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黄瓜CDPK基因家族的鉴定与进化特征分析

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[目的]对黄瓜基因组中CDPK基因的鉴定和进化特征的分析,为深入探索黄瓜CDPK蛋白生物学功能提供理论依据.[方法]用生物信息学方法,在黄瓜的全基因组范围内鉴定C DPK基因,并分析该基因的结构、染色体分布、进化关系及功能域.[结果]在黄瓜全基因组库中总共鉴定出17个CsCPKs,被分为4类;所有CsCPKs均含有6～8个内含子且都具有motif1～10,motif12和motif14;所编码氨基酸序列中含有4个EF-手型结构;多数CsCPKs具有棕榈酰化位点.[结论]CsCPKs都具有ATP结合、Ca2+结合和蛋白激酶活性的分子功能,参与蛋白质磷酸化的生物过程,而特有的motif决定了某些CsCPKs特有的生物学功能.
Identification and Evolutionary Characteristics of CDPK Gene Family in Cucumber

靳燕、王谢琴、卿华、马政、姚慧鹏

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四川农业大学生命科学学院,四川雅安 625014

黄瓜 钙依赖性蛋白激酶 全基因组分析 蛋白质结构域预测

四川农业大学2020年学科建设双支计划

2021993090

2021

10.16036/j.issn.1000-2650.2021.01.004

四川农业大学学报
四川农业大学

四川农业大学学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.657
ISSN：1000-2650
年,卷(期)：2021.39(1)
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