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四川地区一株PCV2的分离鉴定及基因组序列分析

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为了解猪圆环病毒2型(PCV2)当前流行分离株的基因型和进化特征,本研究对PCV2阳性临床样品进行分离鉴定,并对分离毒株进行全基因组序列扩增、测序及遗传进化分析,利用MegAlign7.0和DNAstar软件对分离株ORF2基因编码的Cap蛋白进行氨基酸变异分析和抗原指数预测分析.测序结果显示,PCV2分离株(SMU-2022)的全基因组序列长度为1767 nt.全基因组和Cap蛋白的遗传进化树结果均显示分离株属于PCV2d基因型,与国内外46株参考毒株的相似性在91.8%～99.1%之间,其中与QZ1410毒株的相似性最高,亲缘关系最接近.关键氨基酸位点变异分析表明,在Cap蛋白上有2个氨基酸特异性突变位点,分别是V30L和T232K.抗原指数分析发现,分离株的Cap蛋白抗原指数与4株疫苗株相比差异较大,主要集中在第20-30、40-75、90-100、130-140、195-205、210-220位氨基酸这6个区域.

陈劲松、郭紫晶、黄雄挺、张志东、李彦敏

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西南民族大学动物医学四川省高等学校重点实验室,四川 成都 610041

猪圆环病毒2型(PCV2) ORF2基因型 Cap蛋白 抗原指数 遗传进化分析

中央高校基本科研业务费专项西南民族大学项目西南民族大学引进高层次人才科研项目四川省自然科学基金

ZYN2023042RQD2021002022NSFSC0073

2024

四川畜牧兽医
四川省畜牧食品局 四川省畜牧兽医学会 四川省畜牧科学研究院

四川畜牧兽医

影响因子：0.131
ISSN：1001-8964
年,卷(期)：2024.51(2)
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