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桃YABBY转录因子家族的生物信息学分析

Bioinformatic Analyses of YABBY Transcription Factors in Prunus persica

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为了解桃中YABBY家族的成员和特征,本研究基于桃(Prunus persica)最新基因组组装注释数据,首次通过生物信息学手段系统鉴定并分析了YABBY基因家族特征,包括染色体定位、蛋白特征、基因结构、进化关系、保守结构域、启动子区域顺式元件.结果显示:桃中含有6个YABBY基因,分布在5条染色体上,其推导蛋白序列较短,分子量较小.家族成员含有4～6个内含子,结构较为复杂.桃中YABBY基因含有植物YABBY家族所有5个亚类,即CRC、INO、FIL/YAB3、YAB2和YAB5,且均含有保守的锌指结构和YABBY结构域.除了核心启动元件,桃YABBY基因还含有大量光应答、激素响应等顺式作用元件,表明该家族基因的表达可能会受到环境、激素等的影响.本研究初步研究了桃基因组中YABBY基因家族的特征,为后期该基因家族在桃中的功能验证提供了理论支撑.

韩继红、刘金凤、刘慧敏

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濮阳市市容环境卫生管理处,河南 濮阳 457000

中国林业科学研究院经济林研究开发中心,国家林业和草原局泡桐研究开发中心,经济林种质创新与利用国家林业和草原局重点实验室,河南 郑州 450003

桃 YABBY 进化分析 转录因子

中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金

CAFYBB2017ZA004-7

2020

10.3969/j.issn.1000-2324.2020.06.002

山东农业大学学报(自然科学版)
山东农业大学

山东农业大学学报(自然科学版)

CSTPCD北大核心
影响因子：0.565
ISSN：1000-2324
年,卷(期)：2020.56(6)
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