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基于网络药理学和分子对接法揭示透解祛瘟颗粒防治新冠肺炎的活性成分及作用机制

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目的 探索透解祛瘟颗粒治疗新冠肺炎的活性成分及作用机制,为透解祛瘟颗粒在新冠肺炎防治中的应用提供科学依据.方法 通过查阅参考文献和TCMSP数据库检索筛选透解祛瘟颗粒的化学成分,采用TCMSP和CTD数据库检索透解祛瘟颗粒化学成分的靶蛋白或靶标基因,使用String数据库进行蛋白-蛋白相互作用(PPI)分析得到核心靶点和核心化合物,通过Cytoscape软件构建可视化药材-活性成分-核心靶点网络,并进行拓扑分析和对核心靶点进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,再将核心化合物与血管紧张素转化酶2(ACE2)、3CL水解酶(MPro)和木瓜样蛋白酶(PLP)进行分子对接,探讨其在抑制新冠病毒(SARS-CoV-2)感染和复制方面的活性;预测透解祛瘟颗粒防治新冠肺炎的作用机制.结果 网络拓扑分析筛选得到132个核心靶点和109个核心化合物,关键靶点涉及环氧化酶(PTGS2)、胱天蛋白酶3(CASP3)、白细胞介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、TP53、AKT1、MAPK3、血管内皮生长因子A(VEGFA)、MAPK1、信号传导与转录激活因子3(STAT3)、JUN、甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)、INS、ALB和AR等.通路富集得到甲型流感、小细胞肺癌、肿瘤坏死因子、Toll样受体、PI3K-Akt和HIF-1等关键信号通路.分子对接结果 表明,透解祛瘟颗粒中化学成分中与血管紧张素转化酶2、3CL水解酶和木瓜样蛋白酶对接结果 结合能超过平均值的化合物分别为58、64和56个.结论 透解祛瘟颗粒中的活性成分能通过作用于血管紧张素转化酶2、3CL水解酶和木瓜样蛋白酶发挥抑制病毒感染宿主细胞及自我复制的进程,也能通过多靶点多通路抑制细胞因子风暴,减少肺纤维化的形成,改善低氧血症,有效的防治新冠肺炎.
Uncovery of the action mechanisms and major bioactive compounds responsible for theprotective effects of Toujie Quwen Granules on COVID-19 based on network pharmacology and molecular docking

饶鸿宇、谌攀、吴灏、王永刚、李沛波、苏薇薇

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中山大学广东省中药上市后质量与药效再评价工程技术研究中心/中山大学生命科学学院,广东 广州510275

透解祛瘟颗粒 新型冠状病毒肺炎 网络药理学 分子对接

2020

药学研究
山东省药品检验所 山东省药学会

药学研究

影响因子:0.653
ISSN:2095-5375
年,卷(期):2020.39(12)
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