自身免疫性葡萄膜炎患者外周血转录组差异表达基因分析

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万方数据
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中文摘要：目的分析自身免疫性葡萄膜炎(AU)患者外周血转录组差异表达基因。方法选择AU患者4例，采集外周静脉血4 mL，分离有核细胞，采用流式细胞术检测HLA-B27。利用高通量测序技术对细胞中所有mRNA进行测序，通过云平台分析获得与AU相关的差异表达基因、功能富集分析和蛋白-蛋白互作网络(PPI)等转录组学特征。结果样本有效浓度均达标，Q20、Q30符合测序质量要求，GC含量无明显偏倚，测序结果有效。共筛选出差异表达基因2 638个，其中表达上调基因1 876个、表达下调基因762个;聚类分析显示，组内样本差异表达基因的高低表达分布集中，组间样本则距离较远，提示差异表达基因的聚类性较好。差异表达基因GO富集分析显示，差异表达基因能够参与免疫应答、白细胞激活、细胞活化等生物学过程;KEGG通路富集分析显示，差异表达基因主要富集于破骨细胞分化、NF-κB、趋化因子等信号通路;PPI分析发现，POLR2A、RBPJ、SUPT5H等基因处于PPI的核心位置。结论 AU患者外周血转录组差异表达基因较多，其中CXCL8、FFAR2、HBB等表达上调，SLC4A10、CD27、PAQR等表达下调。这些差异表达基因能够通过多种途径参与AU的发生、发展。

作者：

戴永刚、程世亮、王珏、钱景荣、王洪亚

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作者单位：

山东省立第三医院检验科,济南 250031

关键词：

自身免疫性葡萄膜炎转录组学差异表达基因

出版年：

2024

DOI：

10.3969/j.issn.1002-266X.2024.01.019

山东医药