目的:探讨基本医疗保险住院费用支付对医院的影响.方法:调查北京市平谷区中医医院2017年、2018年医保住院患者的住院情况和基本医保住院费用超支情况.结果:2017年、2018年医保住院患者分别为12 728人、14 928人,分别占比76.93%、82.72%.住院患者人均手术治疗费用为23 218.29元和28 721.91元,分别占比54.21%、56.92%.2017 ~2018年,基本医保住院费用超支的结算科室逐年增加,超支付标准费用也逐年增加,超支总费用分别为452.18万元和538.92万元.结论:北京市平谷区中医医院医保住院费用超支情况较严重,对医院都有一定的影响.为此需要缩短基本医保患者平均住院天数、完善社会医疗保险基金支付系统、加强医疗费用控制,从而保障基本医疗保险住院费用支付的可持续发展.