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阴虚体质中lnc RNA和mRNA表达谱分析及调控网络研究

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目的:体质在疾病的形成、发展和转归中起着重要作用.本研究从转录组学水平首次初步揭示阴虚体质者外周血中lncRNA和mRNA的表达谱及相关作用网络.方法:运用Agilent Human lncRNA+mRNA(4×180 k)表达谱芯片,从阴虚体质(n=10)和平和体质(n=9)者的外周血中分离单个核细胞(PBMCs),采用"limma"方法筛选2组的差异基因,然后对其进行GO功能和IPA通路的显著性富集分析,并寻找lncRNA近距离调控的靶基因.结果:差异表达的lncRNAs和mRNAs均能够将阴虚体质和平和体质进行区分.阴虚体质中有显著差异表达的lncRNAs 829个(282个上调,547个下调)和mRNAs 1435个(1038个上调,397个下调).GO功能富集和IPA作用通路结果提示,这些差异表达基因主要与免疫调节、代谢紊乱和信号传导失常通路显著相关.例如,T细胞受体信号转导,NF-κB信号通路,L-arabinose代谢过程和I型糖尿病信号传导等.确定了7个lncRNA-mRNA相互作用对,比如,LTA-HCP5、ORAI3-AC135048.13和BCL7C-AC135048.13等.结论:阴虚体质易感干眼症、高血压、糖尿病等疾病的物质基础可能与lncRNAs/mRNAs的免疫调节、代谢作用和信号传导失常相关.
Analyses of Long non-coding RNA and mRNA Expression Profiles and Research on the Regulatory Network in Subjects with the Yin Deficiency Constitution

董丽丹、李玲孺、李博怿、严云、郑燕飞、王琦

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北京中医药大学国家中医体质与治未病研究院,北京,100029

长链非编码RNA 阴虚体质 生物信息学 中医

中国博士后基金中央高校基本科研业务费专项资金特色学科专项

2018M6412832019-JYB-TSXK-001

2021

10.3969/j.issn.1673-7202.2021.01.024

世界中医药
世界中医药学会联合会

世界中医药

CSTPCDCHSSCD
影响因子：1.266
ISSN：1673-7202
年,卷(期)：2021.16(1)
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