首页|慢性阻塞性肺疾病差异基因与中药预测的生物信息学分析

慢性阻塞性肺疾病差异基因与中药预测的生物信息学分析

扫码查看
原文链接
  • 国家科技期刊平台
  • NETL
  • NSTL
  • 万方数据
  • 维普
目的:通过生物信息学技术分析比较慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者与健康人的基因芯片数据,初步筛选COPD的差异表达基因,并借助差异表达基因预测治疗COPD的潜在中药药物.方法:首先通过R分析GSE27597和GSE106986基因数据,得到139个差异表达基因,对差异表达基因进行基因本体(GO)富集分析,并通过String数据库、Cytoscape软件及其插件分析得到14个核心基因,然后对核心基因进行Reactome、KEGG、PANTHER等通路注释,最后通过核心基因与医学本体信息检索平台(Coremine Medical)相互映射,筛选治疗COPD的中药.结果:通过MCODE筛选出14个核心基因包括MMP8、PTX3、DEFA4、CHRM2、FPR2、CX3CR1、FPR1、ORM1、APLNR、PPBP、CHIT1、AGTR2、ARG1,与中性粒细胞脱颗粒、先天免疫系统、趋化因子信号通路等密切相关,其中FPR1和CX3CR1通过影响中性粒细胞向肺部的迁移活动成为COPD病理变化的关键.治疗COPD的潜在中药药物包括黄连、黄芪、黄芩、半夏、丹参、厚朴、姜黄、郁金、瓜蒌等.结论:部分基因会促进香烟烟雾暴露诱发COPD的发生,通过miRNA进行调节可能是中药治疗COPD的潜在作用机制.
Bioinformatics Analysis of Differential Genes in Chronic Obstructive Pulmonary Disease and Prediction of Chinese Medicinal

吴思骐、刘建博

展开 >

广州中医药大学第一临床医学院,广州,510405

广州中医药大学第一附属医院,广州,510405

差异表达基因 慢性阻塞性肺疾病 微小RNA 中药 香烟烟雾

粤中医办函 [2018]5号201803010053

2021

10.3969/j.issn.1673-7202.2021.14.023

世界中医药
世界中医药学会联合会

世界中医药

CSTPCDCHSSCD
影响因子：1.266
ISSN：1673-7202
年,卷(期)：2021.16(14)
  • 2
  • 12