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幽门螺杆菌阳性萎缩性胃炎大鼠生物信息分析及安胃汤影响的研究

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目的:基于生物医学大数据筛选幽门螺杆菌(Hp)相关性慢性萎缩性胃炎的关键基因,探索其发病机制及安胃汤对其的影响.方法:从数据库Gene Expression Omnibus(GEO)下载Hp相关性慢性萎缩性胃炎相关芯片数据,利用GEO2 R软件筛选出Hp相关性慢性萎缩性胃炎差异基因,进行生物信息学分析,根据蛋白参与通路数量确定核心蛋白,建立Hp阳性慢性萎缩性胃炎大鼠模型,用PCR和蛋白质印迹法(Western Blotting)进行检测并观察安胃汤对其表达的影响.结果:经过检索分析GSE13873和GSE27411系列芯片数据被纳入,取2个芯片交集的20个差异基因进行生物信息学分析,发现载脂蛋白A1、CD36、囊性纤维化穿膜传导调节蛋白(CFTR)可能是信号通路的核心蛋白.Western Blotting及PCR结果显示Hp相关性慢性萎缩性胃炎大鼠胃组织中,CD36蛋白表达下调(P<0.05),载脂蛋白A1和CFTR蛋白表达上调(P<0.05);与模型组比较,实验观察高剂量组、实验观察中剂量组和实验观察低剂量组胃组织中CD36蛋白表达上调,载脂蛋白A1和CFTR表达下调(P<0.05),其与Hp相关性慢性萎缩性胃炎发病关系密切.结论:通过对GEO中Hp相关性慢性萎缩性胃炎芯片生物信息学分析结合Western Blotting及PCR进一步的验证发现载脂蛋白A1、CD36、CFTR作为信号通路的核心蛋白实验结果与生物信息学分析结果一致.
Bioinformatics Analysis of Helicobacter pylori-Positive Rats with Atrophic Gastritis and the Effect of Anwei Decoction

徐杉、周瑞东、龚纯、蒙毅、张帆、郑景辉、唐友明、朱永苹

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广西中医药大学,南宁,530200

湖北中医药大学附属公安中医医院,荆州,434300

广西中医药大学附属瑞康医院消化内科,南宁,530011

慢性萎缩性胃炎 幽门螺旋杆菌 生物信息学 基因芯片 安胃汤 载脂蛋白A1 CD36 囊性纤维化穿膜传导调节蛋白

国家自然科学基金广西自然科学基金广西自然科学基金广西一流学科建设开放课题自然科学研究项目广西研究生教育创新计划

818608432017GXNSFAA1981112018GXNSFAA2810632019XK165XYJ20054

2022

10.3969/j.issn.1673-7202.2022.10.006

世界中医药
世界中医药学会联合会

世界中医药

CSTPCDCHSSCD
影响因子：1.266
ISSN：1673-7202
年,卷(期)：2022.17(10)
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