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黄芩MYB转录因子家族全基因组鉴定与分析

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目的:黄芩中主要活性成分黄酮类化合物的生物合成途径已解析,但相关调控机制研究薄弱.本研究基于黄芩全基因组对SbMYB转录因子进行系统鉴定和分析,筛选可能参与黄酮类化合物生物合成的候选SbMYB家族成员.方法:通过HMMER和BLAST筛选SbMYB转录因子;采用IQ-TREE、ExPASy、GSDS、TBtools、Cytoscape等在线工具和软件对Sb-MYB家族的进化关系、基因结构、基因表达模式、蛋白调控网络等进行生物信息学分析.结果:全基因组水平上共鉴定到146个SbMYB转录因子,分为4个亚族和1个未分族成员,R2R3-MYB亚族成员最多(116个);SbMYB基因结构较为保守,随机分布在9条染色体上;同一亚族有相似的MYB保守结构域和基序组成;SbMYB在根、茎、叶中具有相似的表达模式,与花中差异较大;SbMYB与黄酮合成相关结构基因的蛋白质-蛋白质相互作用分析筛选到43个SbMYB可能调控黄酮合成途径关键酶.结论:MYB转录因子调控植物次生代谢合成,本研究系统分析黄芩MYB转录因子家族并筛选可能参与黄酮类化合物生物合成的候选基因,为其调控机制研究奠定基础.
Genome-wide Identification and Analysis of MYB Transcription Factor Gene Family in Scutellaria baicalensis

王晓童、向丽、邬兰、高冉冉

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中国中医科学院中药研究所/青蒿素中心,北京,100700

东北林业大学生命科学学院,哈尔滨,150040

黄芩 MYB转录因子 黄酮类化合物 基因调控网络

国家自然科学基金委-贵州喀斯特中心项目国家重点研发计划

U1812403-12019YFC1711100

2022

10.3969/j.issn.1673-7202.2022.13.003

世界中医药
世界中医药学会联合会

世界中医药

CSTPCDCHSSCD
影响因子：1.266
ISSN：1673-7202
年,卷(期)：2022.17(13)
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