摘要
目的:借助网络药理学和分子对接技术探讨黄芪治疗慢传输型便秘的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选黄芪的活性化合物并预测其作用靶点,借助Cytoscape 3.7.2 软件构建黄芪活性成分-靶点网络图;以"slow transit contipation"为关键词在OMIM及GeneCards数据库检索慢传输型便秘相关靶点,并与黄芪化合物作用靶点取交集,将共同靶点导入String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,将PPI导入Cytoscape 3.7.2 进行拓扑分析;利用R语言进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析预测其作用机制;通过Swiss Dock在线分子对接工具对关键靶点进行分子对接.结果:黄芪筛选得到20 个活性成分,对应作用靶点 189个,与慢传输型便秘的共同靶点 143 个,交集String数据库和Cytoscape 3.7.2 拓扑分析度值靠前的靶标为血管内皮生长因子A(VEGFA)、丝氨酸苏氨酸蛋白激酶 1(AKT1)、胱天蛋白酶 3(CASP3)、白细胞介素-6(IL-6).GO功能富集分析得到生物过程、细胞组分、分子功能条目分别有 1 943、77、153 个,KEGG功能富集分析得到信号通路 163 条.分子对接结果显示叶酸、1,7-二羟基-3,9-二甲氧基紫檀素、山柰酚、槲皮素是黄芪发挥治疗作用的主要成分.结论:黄芪中的活性化合物叶酸、山柰酚、槲皮素等能作用于JUN、VEGFA、AKT1、CASP3、IL-6 等靶点,通过调控对抗生素反应、对氧化应激的反应、对营养水平的反应、薄膜筏、核受体活性、细胞因子受体结合等信号通路发挥治疗慢传输型便秘的作用.
国家科技期刊平台
NSTL
维普
万方数据