首页|林麝不同组织miRNA表达谱

林麝不同组织miRNA表达谱

扫码查看
原文链接
  • 国家科技期刊平台
  • NETL
  • NSTL
  • 万方数据
  • 维普
林麝(Moschus berezovskii)是药用经济动物,其雄麝分泌的麝香是中成药和香水的重要成分,具有极高的药用价值和经济价值.miRNAs在动物细胞发育、分化、凋亡及疾病发生发展过程中起着至关重要的作用,并且在不同组织中miRNAs选择性表达.本研究利用RNA-seq技术在Hi-seq 2500测序平台对林麝的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和肌肉组织进行高通量测序,运用生物统计学和生物信息学方法分析这6种器官和组织中miRNAs的表达情况,采用RT-qPCR对测序结果进行验证.结果表明,林麝的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和肌肉组织中共表达的miRNAs有1 650个,特异表达的miRNAs分别有86个、54个、44个、68个、83个和50个(P＜0.01),共表达的miRNAs在不同器官和组织中表达水平存在显著差异(P＜0.05),林麝心脏中部分特异miRNAs的表达水平远远高于其他5种器官和组织中特异miRNAs的表达水平.KEGG分析表明:林麝肝脏特异表达miR-NA 靶基因主要涉及 Wnt 信号通路(ko04310)、cAMP信号通路(ko04024)、ECM 受体相互作用(ko04512)、Notch 信号途径(ko04330)、AMPK信号通路(ko04152)等(P＜0.01).随机选择9个miRNAs,利用RT-qPCR验证其在健康和化脓性林麝肝脏中的表达情况,结果表明其中9个miRNAs的表达趋势与测序结果一致.
The expression profile of miRNA in the different tissues of forest musk deer(Moschus berezovskii)

MicroRNAExpression profileExpression analysisFluorescence quantitative PCRForest musk deer

余苗杰、徐忠鲜、蒋雪梅、王春花、赵婵娟、戚文华、竭航

展开 >

重庆三峡学院生物与食品工程学院,重庆 404100

西华师范大学生命科学学院,南充 637009

湖南农业大学动物医学院,长沙 410125

重庆三峡职业学院,重庆 404155

重庆市药物种植研究所,重庆 408435

展开 >

microRNA 表达谱 表达分析 荧光定量PCR 林麝

国家自然科学基金国家自然科学基金重庆市自然科学基金重庆市自然科学基金中国博士后科学基金

8227404632370560estc2019jcyjmsxmX0410CSTB2023NSCQ-MSX01232017M612959

2023

10.16829/j.slxb.150744

兽类学报
中国科学院西北高原生物研究所,中国动物学会兽类学分会

兽类学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.804
ISSN：1000-1050
年,卷(期)：2023.43(6)
  • 17