本研究测定了低GC含量的双歧杆菌(Bifidobacterium inopinatum)和新种B.thermacidophilum的16S rDNA全序列,在同另外19个双歧杆菌及 8个相关细菌的16S rDNA同源性分析的基础上构建了系统发育树.结果表明:除低GC含量的B.inopinatum外,所有双歧杆菌的种在16S rDNA序列相似性≥92%的水平上聚类为一个簇群.尽管B.inopinatum与其它种的双歧杆菌的相似性只有87%~89%,但它仍与双歧杆菌的关系最密切,而并未显示出与GC含量相近属的特殊亲缘关系.本研究结果未显示出在革兰氏阳性细菌分支中,由低GC到高GC含量的细菌种群的系统演化模式.此外,研究结果提示在细菌系统发育研究中,由16S rDNA序列和基因组DNA同源性产生的矛盾需借助于其它保守的生物大分子来澄清.