生物工程学报2022，Vol.38Issue(1) ：5-13.DOI:10.13345/j.cjb.210085

纳米孔测序技术在环境微生物研究中的应用

Application of nanopore sequencing in environmental microbiology research

李中浤 杜彩丽 林彦锋 张列宇 李晓光 黎佳茜 陈素华
生物工程学报2022，Vol.38Issue(1) ：5-13.DOI:10.13345/j.cjb.210085
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纳米孔测序技术在环境微生物研究中的应用

Application of nanopore sequencing in environmental microbiology research

李中浤 1杜彩丽 2林彦锋 3张列宇 2李晓光 2黎佳茜 2陈素华4
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作者信息

  • 1. 中国环境科学研究院国家环境保护地下水污染过程模拟与控制重点实验室,北京100012;南昌航空大学环境与化学工程学院,江西南昌330063
  • 2. 中国环境科学研究院国家环境保护地下水污染过程模拟与控制重点实验室,北京100012
  • 3. 中国人民解放军疾病预防控制中心生物安全科,北京100071
  • 4. 南昌航空大学环境与化学工程学院,江西南昌330063
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摘要

高通量测序技术是研究环境微生物的有效手段,而以纳米孔测序为代表的第三代测序技术以其测序读长长、测序速度快、测序数据实时监控、仪器方便携带、无GC偏好性、无需经过PCR扩增等显著优势有力推动了环境微生物研究的发展.本文对纳米孔测序技术的技术原理和特点进行了简要概述,重点介绍了纳米孔测序技术在环境微生物扩增子测序、宏基因组测序、全基因组测序等领域的研究应用,并分析了纳米孔测序技术在环境微生物应用中的优势及存在的问题.

关键词

纳米孔测序技术/扩增子测序/宏基因组测序/全基因组测序/环境微生物

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基金项目

国家重点研发计划(2019YFC0409202)

出版年

2022
生物工程学报
中国科学院微生物研究所 中国微生物学会

生物工程学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.641
ISSN：1000-3061
被引量4
参考文献量5
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