生物工程学报2022，Vol.38Issue(1) ：238-251.DOI:10.13345/j.cjb.210012

紫鸭跖草热激转录因子基因家族鉴定及在Cu2+胁迫下表达模式分析

Identification of heat stress transcription factors gene family in Setcreasea purpurea and analysis of its expression pattern under Cu2+ stress

彭国颖 卢山 杨坤 万玮 黄长干
生物工程学报2022，Vol.38Issue(1) ：238-251.DOI:10.13345/j.cjb.210012
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紫鸭跖草热激转录因子基因家族鉴定及在Cu2+胁迫下表达模式分析

Identification of heat stress transcription factors gene family in Setcreasea purpurea and analysis of its expression pattern under Cu2+ stress

彭国颖 1卢山 1杨坤 1万玮 1黄长干1
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作者信息

  • 1. 江西农业大学南昌市植物资源化学利用重点实验室,江西南昌330045
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摘要

热激转录因子(Hsf)是植物中最重要的转录因子家族之一,在植物遭遇热、干旱和重金属等多种非生物胁迫中具有重要的作用.为明确紫鸭跖草Hsf基因家族的结构及功能,从紫鸭跖草全长转录组数据库筛选鉴定出20个SpbHsf基因,并运用生物信息学工具和qRT-PCR进行分析.结果 显示:SpbHsf蛋白均为亲水性蛋白,定位于细胞核的SpbHsf蛋白有12个,所有SpbHsf蛋白二级结构的α螺旋和无规卷曲的含量较高.SpbHsf基因分为3个亚族,各亚族都包含独特的保守基序.全部SpbHsf蛋白含有DBD和HR-A/B结构域.系统进化分析显示,与SpbHsf蛋白同源性最高的是水稻OsHsf蛋白.20个SpbHsf基因在紫鸭跖草根组织中均有表达.相比于对照组,根组织在Cu2+胁迫下,8个SpbHsf基因的表达量显著上调,8个SpbHsf基因的表达量显著下调.研究结果为紫鸭跖草Hsf基因家族的功能验证及表达模式提供了一定的理论参考.

关键词

紫鸭跖草/热激转录因子/生物信息学/表达分析

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基金项目

国家自然科学基金(31760068)

出版年

2022
生物工程学报
中国科学院微生物研究所 中国微生物学会

生物工程学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.641
ISSN：1000-3061
被引量1
参考文献量6
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