生物工程学报2022，Vol.38Issue(2) ：460-477.DOI:10.13345/j.cjb.210229

人工微生物混菌系统机制解析中的组学应用及进展

Using OMICS technologies to analyze the mechanisms of synthetic microbial co-culture systems:a review

国陶红 宋馨宇 陈磊 张卫文
生物工程学报2022，Vol.38Issue(2) ：460-477.DOI:10.13345/j.cjb.210229
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人工微生物混菌系统机制解析中的组学应用及进展

Using OMICS technologies to analyze the mechanisms of synthetic microbial co-culture systems:a review

国陶红 1宋馨宇 2陈磊 1张卫文2
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作者信息

  • 1. 天津大学化工学院合成微生物学实验室,天津300072;教育部合成生物学前沿科学中心,天津300072;教育部系统生物工程重点实验室,天津300072
  • 2. 天津大学化工学院合成微生物学实验室,天津300072;教育部合成生物学前沿科学中心,天津300072;教育部系统生物工程重点实验室,天津300072;天津大学生物安全战略研究中心,天津300072
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摘要

人工微生物混菌系统的生物工程应用价值日益受到重视,使得对于混菌系统中成员菌间的相互作用机制研究也成为近年来的一个热点.其研究结果一方面可以为现有人工混菌系统的进一步优化提供理论依据,另一方面也为全新混菌系统的人工构建提供新的思路和策略,进而促进人工微生物混菌系统未来规模化应用.基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等研究方法能够高通量分析各种生物分子、提供大量的数据与信息,多组学分析可以获得混菌系统中细胞的"全景",在揭示人工微生物混菌系统中各个成员间的相互作用的研究中有着特殊的意义.文中综述了近年来多种组学技术在人工微生物混菌系统机制解析中的应用及研究进展,从代谢网络、能量代谢、信号转导、膜转运、胁迫响应、混菌系统的稳定性以及结构合理性等方面探讨混菌系统机制解析的最新进展,以期为利用合成生物学、基因组编辑等新兴生物技术改造微生物混菌系统实现其工程化应用提供理论依据.

关键词

混菌系统/相互作用/组学/机制解析

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基金项目

国家重点研发计划(2019YFA0904600)

国家重点研发计划(2020YFA0906800)

国家重点研发计划(2018YFA0903000)

国家重点研发计划(2018YFA0903600)

国家自然科学基金(31901016)

国家自然科学基金(91751102)

国家自然科学基金(31770035)

国家自然科学基金(31770100)

国家自然科学基金(31972931)

国家自然科学基金(21621004)

国家自然科学基金(31370115)

国家自然科学基金(3140217)

出版年

2022
生物工程学报
中国科学院微生物研究所 中国微生物学会

生物工程学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.641
ISSN：1000-3061
被引量3
参考文献量5
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