生物工程学报2022,Vol.38Issue(3) :1050-1060.DOI:10.13345/j.cjb.210207

耻垢分枝杆菌EF-G敲低菌株的构建和耐药分析

Construction of EF-G knockdown strain of Mycobacterium smegmatis and drug resistance analysis

狄玉昌 白嘉诚 迟明哲 范伟兴 张雪莲
生物工程学报2022,Vol.38Issue(3) :1050-1060.DOI:10.13345/j.cjb.210207

耻垢分枝杆菌EF-G敲低菌株的构建和耐药分析

Construction of EF-G knockdown strain of Mycobacterium smegmatis and drug resistance analysis

狄玉昌 1白嘉诚 1迟明哲 1范伟兴 2张雪莲1
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作者信息

  • 1. 复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室,上海200433
  • 2. 中国动物卫生与流行病学中心,山东青岛266032
  • 折叠

摘要

GTPase延伸因子G(elongation factor G,EF-G)是蛋白质翻译过程中重要的翻译因子.作为唯一在翻译延伸和核糖体再生2个翻译环节发挥重要功能的翻译因子,EF-G成为潜在的抗菌药物作用靶点.耻垢分枝杆菌(Mycobacterium smegmetics,Msm)和结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)基因组中均存在2个EF-G同源编码基因,分别为MsmEFG1(MSMEG_1400)和MsmEFG2(MSMEG_6535),fusA1(Rv0684)和 fusA2(Rv0120c).基因突变库和生物信息学推测MsmEFG1(MSMEG_1400)和fusA1(Rv0684)是生长必需基因.为探究分枝杆菌中EF-G的生物学功能及特点,利用成簇的规律间隔的短回文重复序列干扰(clustered regularly interspaced short palindromic repeats interference,CRISPRi)技术构建了耻垢分枝杆菌中2个EF-G诱导型敲低菌株(Msm-△EFG1(KD)和Msm-△EFG2(KD)),研究发现EF-G2的敲低对细菌生长无影响,而EF-G1的敲低显著影响分枝杆菌的生长,成膜能力显著减弱、菌落形态显著变化、菌体长度显著增长,推测EF-G可能与细菌的分裂相关.最低抑菌浓度(minimal inhibitory concentration,MIC)实验结果表明,抑制EF-G1的表达可增强分枝杆菌对利福平、异烟肼、红霉素、夫西地酸、卷曲霉素等抗菌药物的敏感性,提示EF-G1可能成为未来抗结核药物筛选的潜在靶标,为探究EF-G在分枝杆菌中的生理功能及作为潜在药物靶标提供基础.

关键词

耻垢分枝杆菌/EF-G/成簇规律间隔短回文重复序列干扰(CRISPRi)/最小抑菌浓度/耐药

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基金项目

国家自然科学基金(81971898)

国家自然科学基金(81673482)

国家重点研发计划(2016YFA0500601)

新疆建设兵团科技攻关计划重点项目(2020AB015)

出版年

2022
生物工程学报
中国科学院微生物研究所 中国微生物学会

生物工程学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.641
ISSN:1000-3061
被引量1
参考文献量1
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