生物工程学报2022,Vol.38Issue(6) :2213-2223.DOI:10.13345/j.cjb.210758

在cDNA文库构建中探究癌症病人血浆外泌体miRNA的特异性扩增

Specific amplification of plasma exosome miRNA in cancer patients for construction of cDNA library

王娜 何飞 郁宏伟 何栾樱 熊国良 卢建东 喻长远 王诗卉
生物工程学报2022,Vol.38Issue(6) :2213-2223.DOI:10.13345/j.cjb.210758

在cDNA文库构建中探究癌症病人血浆外泌体miRNA的特异性扩增

Specific amplification of plasma exosome miRNA in cancer patients for construction of cDNA library

王娜 1何飞 1郁宏伟 1何栾樱 1熊国良 2卢建东 2喻长远 1王诗卉1
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作者信息

  • 1. 北京化工大学生命科学与技术学院,北京100029
  • 2. 深圳市中医院,广东 深圳518000
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摘要

血浆外泌体微小核糖核酸(microRNAs,miRNAs)与癌症的发生、诊断和治疗密切相关,但其分子机制尚不明晰.本研究探讨了癌症病人血浆外泌体miRNAs在cDNA文库构建中非特异性扩增的解决方案.在酶切法中,采用核酸外切酶T(exonucleaseT,EXOT)和phi29 DNA聚合酶降解引物;在磁珠法中,利用DNA结合磁珠分离模板和引物.随后,采取琼脂糖凝胶电泳和变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测磁珠分离情况,运用 RT-qPCR检测癌症病人血浆外泌体miRNA和不同连接物的含量变化.结果显示,非特异性扩增来源于miRNA的连接物USR5SR;核酸外切酶T(EXOT)和phi29DNA聚合酶虽可降解USR5SR,但模板链也会发生降解;磁珠分离法中以9%PEG沉淀引物片段、15%PEG沉淀模板链效果最佳.综上所述,磁珠分离法能够高效解决cDNA文库构建中的非特异性扩增,从而实现293T细胞和癌症病人血浆外泌体miRNA cDNA文库的成功构建.

关键词

microRNAs/cDNA文库/磁珠分离/非特异性扩增

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基金项目

国家十三五科技重大专项(2019ZX09721001-007-002)

深圳科学技术项目(JCYJ20180507183842516)

国家重点研发计划(218YFA0903000)

国家自然科学基金(82174531)

国家自然科学基金(21606013)

出版年

2022
生物工程学报
中国科学院微生物研究所 中国微生物学会

生物工程学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.641
ISSN:1000-3061
被引量3
参考文献量16
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