摘要
为建立一种快速鉴别严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)的5种主要变异株的TaqMan探针实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,RT-qPCR)体系,基于 SARS-CoV-2 野生型及变异株 alpha(N501Y、HV69-70del)、beta(E484K、K417N)、gamma(K417T、V1176F)、delta(L452R、T478K)和 omicron(H655Y、N679K、P681H)序列设计特异性引物、探针,建立和优化一种鉴别新型冠状病毒(SARS-CoV-2)5种主要变异株的TaqMan探针RT-qPCR方法,并进行该方法的特异性、敏感性、鉴别能力评价.该方法可准确区分出SARS-CoV-2野生型和突变型,与其他呼吸道病原体(n=21)无交叉,显示高特异性.该方法最低检测限为2×102拷贝/mL,操作简单、快速、成本廉价,可用于监测SARS-CoV-2毒株的变异,精准指导疫情识别与防控.
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