生物工程学报2022,Vol.38Issue(8) :2928-2938.DOI:10.13345/j.cjb.220272

鸡Foxp3结构预测及组织表达谱分析

Analysis of the structure of chicken Foxp3 and its expression profile in tissues

常贺 高辉 王永强 高丽 曹红 李晓齐 郑世军
生物工程学报2022,Vol.38Issue(8) :2928-2938.DOI:10.13345/j.cjb.220272

鸡Foxp3结构预测及组织表达谱分析

Analysis of the structure of chicken Foxp3 and its expression profile in tissues

常贺 1高辉 1王永强 1高丽 1曹红 1李晓齐 1郑世军1
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作者信息

  • 1. 中国农业大学动物医学院农业动物流行病学重点实验室,北京100193
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摘要

本研究旨在克隆鸡foxp3(chfoxp3)基因全长编码区序列(coding sequence,CDS),并对其进行生物信息学及组织表达谱分析.以50日龄无特定病原鸡为样本,从脾脏组织中克隆chfoxp3基因全长CDS序列,利用在线工具和软件对chFoxp3进行生物信息学分析,以实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)技术检测chfoxp3基因在鸡各组织中的表达分布情况.研究结果表明,chfoxp3基因包含882 bp的开放阅读框,编码293个氨基酸,chFoxp3分子质量为33.44 kDa,属于亲水蛋白;chFoxp3具有Fox转录因子家族典型的forkhead结构域,含有核定位信号;其二级结构由α-螺旋(29.35%)、延伸链(10.92%)、β-转角(5.12%)和无规则卷曲(54.61%)组成;chfoxp3在不同组织中表达有差异,在鸡心脏及胰腺中表达水平较高,显著高于脾脏、法氏囊以及胸腺等免疫器官(P<0.01),这一特点明显区别于哺乳动物;通过系统进化树分析发现,鸡Foxp3与其他野禽属于相同分支,但与哺乳动物相差较远.这些研究结果为进一步深入研究chFoxp3的免疫调节功能奠定了基础.

关键词

/Foxp3/克隆/表达分析

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基金项目

出版年

2022
生物工程学报
中国科学院微生物研究所 中国微生物学会

生物工程学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.641
ISSN:1000-3061
参考文献量22
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