摘要
TCP(teosinte branched 1/cincinnata/proliferating cell factor)转录因子是植物特有转录因子家族,在植物整个生长发育过程中都有着很重要作用.目前,在茄子(Solanum melongena L.)中还没有关于TCP转录因子的相关报道.本研究利用生物信息学方法在茄子基因组数据库中鉴定出分布于11条染色体上的29个茄子TCP家族基因(eggplant TCP,SmTCP).研究结果显示,该家族所有成员均含有编码TCP保守结构域的序列.这些成员氨基酸长度范围为201-538 aa,外显子数为1或2.亚细胞定位显示,有3个SmTCP(SmTCP02/03/21)蛋白位于细胞质中,其他SmTCP蛋白都位于细胞核中.系统发育树和序列特征分析均将29个SmTCP基因分成Class Ⅰ(PCF)和Class Ⅱ(CIN和CYC/TB1)两大类.共线性分析发现,17对(21个)SmTCP基因存在共线性关系,且这些存在共线性关系的基因都属于片段复制.基因表达模式分析显示,29个SmTCP基因家族成员在15个组织或器官中都有表达,但是不同成员的表达模式存在差异,其中CIN亚家族的4个基因(SmTCP18/19/20/25)在3个不同生长期的叶片中均较高表达.SmTCP启动子区域的顺式作用元件分析共发现4类顺式作用元件.本研究从多个角度分析了 SmTCP基因分子基础,研究了TCP转录因子对茄子生长发育的影响,为茄子分子育种提供理论参考.
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