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扁果草叶绿体基因组特征分析

Characteristics of the chloroplast genome of Isopyrum anemonoides

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为探讨扁果草(Isopyrum anemonoides)叶绿体基因组特征及该属物种的系统发育关系,采用Illumina Hiseq高通量测序技术,对扁果草进行全基因组测序,组装、注释和完成扁果草叶绿体全基因组图谱绘制.结果显示,扁果草叶绿体全基因组总长161 034 bp,为典型的四分体结构,包含85个蛋白编码基因、37个转运RNA和8个核糖体RNA.共检测到44个散在重复序列和47个简单重复序列.此外,扁果草叶绿体基因组中共包含53 678个密码子,其中编码亮氨酸的密码子最多(5 251个),编码色氨酸的密码子最少(712个).共线性分析结果显示,扁果草与近缘种叶绿体基因组中不存在倒位或重排现象.系统发育分析表明,扁果草并未与该属的东北扁果草(I.manshuricum)聚在一个分支上,而是与假耧斗菜(Paraquilegia microphylla)有很近的亲缘关系.本研究为开展后续的扁果草属物种鉴定、系统发育研究提供基础资料.

热伊汉古丽•图尔迪、慕丽红、田新民

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新疆大学生命科学与技术学院新疆生物资源基因工程重点实验室,新疆乌鲁木齐830046

扁果草 高通量测序 简单重复序列位点 叶绿体基因组 系统发育 密码子偏好性

2020D0403331760102

2022

10.13345/j.cjb.210876

生物工程学报
中国科学院微生物研究所 中国微生物学会

生物工程学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.641
ISSN：1000-3061
年,卷(期)：2022.38(8)
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