生物工程学报2022,Vol.38Issue(9) :3528-3541.DOI:10.13345/j.cjb.220055

条纹斑竹鲨肝脏环形RNA的筛选、鉴定及功能分析

Identification and functional characterization of circular RNAs in the liver of whitespotted bamboo shark(Chiloscyllium plagiosum)

覃萍 张文杰 吕正兵
生物工程学报2022,Vol.38Issue(9) :3528-3541.DOI:10.13345/j.cjb.220055

条纹斑竹鲨肝脏环形RNA的筛选、鉴定及功能分析

Identification and functional characterization of circular RNAs in the liver of whitespotted bamboo shark(Chiloscyllium plagiosum)

覃萍 1张文杰 1吕正兵1
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作者信息

  • 1. 浙江理工大学生命科学与医药学院,浙江杭州310018
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摘要

为筛选和验证条纹斑竹鲨肝脏中环形RNA(circRNA)及探究其在肝癌细胞HepG2中过表达对肝癌细胞增殖、迁移能力的影响,本研究主要进行了两项实验:对条纹斑竹鲨肝脏circRNA进行高通量测序和预测,随后设计正、反向引物验证其真实性;构建circRNA过表达载体,将其瞬时转染进肝癌细胞HepG2,进行CCK-8和划痕实验来评价其对肝癌细胞增殖和迁移能力的影响.结果显示:预测到有4 558条circRNAs,并确认了14条circRNAs的真实性;qRT-PCR实验表明在肝癌细胞 HepG2 中能瞬时过表达 circRNA 13-566、circRNA 4-475、circRNA 5-402、circRNA 294-177、circRNA 30-219;且CCK-8和划痕实验显示,这5条circRNAs过表达后,均能不同程度地抑制肝癌细胞的增殖和迁移能力,其中circRNA 4-475、circRNA 294-177作用尤为显著.上述结果为深入研究条纹斑竹鲨肝脏中circRNA及其在肝再生、肝癌治疗方面的功能提供了新思路和基础.

关键词

条纹斑竹鲨/circRNA/鉴定/HepG2/功能

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基金项目

出版年

2022
生物工程学报
中国科学院微生物研究所 中国微生物学会

生物工程学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.641
ISSN:1000-3061
被引量1
参考文献量5
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