生物工程学报2022,Vol.38Issue(10) :3773-3789.DOI:10.13345/j.cjb.220257

甜菜BvHAK基因家族全基因组鉴定及其在盐处理下的表达分析

Genome-wide identification of BvHAK gene family in sugar beet(Beta vulgaris)and their expression analysis under salt treatments

杨小涵 伍国强 魏明 王北辰
生物工程学报2022,Vol.38Issue(10) :3773-3789.DOI:10.13345/j.cjb.220257

甜菜BvHAK基因家族全基因组鉴定及其在盐处理下的表达分析

Genome-wide identification of BvHAK gene family in sugar beet(Beta vulgaris)and their expression analysis under salt treatments

杨小涵 1伍国强 1魏明 1王北辰1
扫码查看

作者信息

  • 1. 兰州理工大学生命科学与工程学院,甘肃兰州730050
  • 折叠

摘要

高亲和性K+转运蛋白(high-affinity K+transporter,HAK)是植物中最重要的K+转运蛋白家族之一,在植物K+吸收和转运过程中发挥重要功能.为探究甜菜BvHAK基因家族成员生物学功能及基因表达模式,采用生物信息学手段,预测了蛋白质的理化性质、基因结构、染色体定位、系统进化、保守基序、三维结构、互作网络、启动子顺式作用元件,并通过qRT-PCR分析了盐胁迫下BvHAKs基因在甜菜不同组织中的表达水平.共鉴定出10个甜菜BvHAK基因家族成员,含有8-10个外显子、7-9个内含子;平均氨基酸个数为778.30,平均分子量为88.31 kDa,等电点为5.38-9.41,跨膜区为11-14个.BvHAK4.-5、-7和-13定位在质膜,而其余定位在液泡膜.系统进化分析发现,高等植物HAK可分为5个簇,分别为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ簇,其中Ⅱ簇成员可进一步分为Ⅱa、Ⅱb和Ⅱc等3个亚簇;BvHAK家族成员则分布在前4簇,分别含有1、6、1和2个成员.甜菜BvHA K基因家族主要含有胁迫响应元件、激素响应元件和生长发育响应元件.进一步对BvHAK基因在盐处理下甜菜不同组织中的表达模式分析发现,50和100 mmol/L NaCl不同程度地诱导甜菜地上部和根部BvHAK基因家族成员的表达;高盐(150 mmol/L)则下调了其在地上部的表达水平.这些结果表明,BvHAK基因家族在响应盐胁迫过程中起重要作用.

关键词

甜菜/高亲和性K+转运蛋白/HAK基因家族/顺式作用元件/耐盐性

引用本文复制引用

基金项目

出版年

2022
生物工程学报
中国科学院微生物研究所 中国微生物学会

生物工程学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.641
ISSN:1000-3061
被引量4
参考文献量7
段落导航相关论文