生物工程学报2022，Vol.38Issue(10) ：3901-3913.DOI:10.13345/j.cjb.220184

定量蛋白质组学揭示酵母去泛素化酶Ubp14生物学功能

Quantitative proteomics reveal the potential biological functions of the deubiquitinating enzyme Ubp14 in Saccharomyces cerevisiae

李招娣 兰秋艳 李衍常 徐聪 常蕾 徐平 段昌柱
生物工程学报2022，Vol.38Issue(10) ：3901-3913.DOI:10.13345/j.cjb.220184
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定量蛋白质组学揭示酵母去泛素化酶Ubp14生物学功能

Quantitative proteomics reveal the potential biological functions of the deubiquitinating enzyme Ubp14 in Saccharomyces cerevisiae

李招娣 1兰秋艳 2李衍常 2徐聪 2常蕾 2徐平 2段昌柱3
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作者信息

  • 1. 重庆医科大学基础医学院细胞生物学与遗传学教研室分子医学与肿瘤研究中心,重庆400016;军事科学院军事医学研究院生命组学研究所中国医学科学院蛋白质组学与药物研发新技术创新单元国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室,北京102206
  • 2. 军事科学院军事医学研究院生命组学研究所中国医学科学院蛋白质组学与药物研发新技术创新单元国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室,北京102206
  • 3. 重庆医科大学基础医学院细胞生物学与遗传学教研室分子医学与肿瘤研究中心,重庆400016
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摘要

泛素化是一种动态可逆的蛋白质翻译后修饰,泛素分子在泛素激活酶、泛素结合酶和泛素连接酶的级联酶促反应催化下共价连接到底物蛋白上.去泛素化酶将泛素分子从底物上移除,动态可逆地调控泛素化修饰,在成熟泛素的生成、泛素链的移除与修剪、游离泛素链的回收等过程中发挥着关键的调控作用.本文的研究对象是酵母中泛素特异性蛋白酶(ubiquitin specific protease,USP)家族成员Ubp 14,负责回收细胞内游离的泛素链.本研究定量比较了酵母细胞中Ubp14缺失对全蛋白质组的影响,进而找出其潜在的调控通路和分子功能.首先,通过同源重组技术构建了 ubp14Δ菌株,发现其生长速度低于野生型酵母.利用稳定同位素氨基酸代谢标记技术结合深度覆盖的蛋白质组学分析技术,系统比较了 ubp14Δ菌株相对于野生型菌株的差异蛋白,共计鉴定3 685个蛋白,通过统计学分析筛选得到109个差异蛋白.基因本体论分析发现,Ubp14缺失引起的差异蛋白主要参与了包括氨基酸代谢、氧化还原和热应激等生物学过程.本研究为深入探究去泛素化酶Ubp14的生物学功能,进而深刻理解游离泛素的稳态平衡与生物学过程调控提供了高可信的蛋白质组学数据信息.

关键词

去泛素化酶/Ubp14/稳定同位素氨基酸代谢标记技术/泛素

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基金项目

出版年

2022
生物工程学报
中国科学院微生物研究所 中国微生物学会

生物工程学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.641
ISSN：1000-3061
被引量2
参考文献量5
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