生物工程学报2022,Vol.38Issue(11) :4146-4161.DOI:10.13345/j.cjb.220590

数字细胞模型的研究及应用

Digital cell models and their applications:a review

袁倩倩 毛志涛 杨雪 廖小平 马红武
生物工程学报2022,Vol.38Issue(11) :4146-4161.DOI:10.13345/j.cjb.220590

数字细胞模型的研究及应用

Digital cell models and their applications:a review

袁倩倩 1毛志涛 1杨雪 1廖小平 1马红武1
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作者信息

  • 1. 中国科学院天津工业生物技术研究所,天津300308;国家合成生物技术创新中心,天津300308
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摘要

组学分析技术的发展推动生物学逐渐成为一门以数据分析为中心的科学.依托生物数据在细胞整体系统水平建立数字细胞模型,对于理解细胞系统组织原理和生命产生进化规律,预测各种环境和基因扰动对细胞功能的影响并指导设计人工生命具有重要意义,因此数字细胞的构建模拟设计已成为合成生物学的核心研究内容与底层支撑技术.本文重点对天津工业生物技术研究所创立十年来在数字细胞研究方面的进展进行回顾介绍,重点包括基因组尺度代谢网络模型的构建、质控以及其在途径设计和指导菌种代谢工程改造方面的应用,进一步结合近年来细胞模型研究的前沿趋势,对整合多种约束的模型的构建和分析研究方面的最新成果进行了介绍,最后对数字细胞研究的未来发展方向进行展望.数字细胞技术将与基因组测序、合成和编辑等合成生物学前沿技术一起提升人们对生命进行读写改创的能力.

关键词

数字细胞/基因组尺度代谢网络/途径设计/多约束模型/代谢工程

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基金项目

国家重点研发计划(2018YFA0900300)

中国科学院国际大科学合作计划(153D31KYSB20170121)

国家自然科学基金(21908239)

天津市合成生物技术创新能力提升行动项目(TSBICIP-PTJS-001)

出版年

2022
生物工程学报
中国科学院微生物研究所 中国微生物学会

生物工程学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.641
ISSN:1000-3061
被引量2
参考文献量6
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