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大白菜NHX基因家族的鉴定与表达分析

Identification and expression analysis of NHX gene family in Chinese cabbage

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Na+/H+逆向转运蛋白(Na+/H+antiporter,NHX)基因家族在植物响应盐胁迫中发挥重要作用.本研究鉴定了大白菜NHX基因家族成员,并分析了大白菜NHX基因(Brassica rapa ssp.Pekinensis NHX,BrNHXs)响应高温、低温、干旱和盐胁迫等非生物逆境的表达模式.结果表明,在大白菜中共鉴定到9个NHX基因家族成员,分布在大白菜的6条染色体上,其氨基酸数目在513-1 154aa之间,相对分子量集中在56 804.22-127 856.66 kDa,等电点位于5.35-7.68之间.该基因家族成员主要存在于液泡中,基因结构完整,外显子的数目介于11-22之间.大白菜NHX基因家族编码的蛋白质二级结构都具有α-螺旋、β-转角和不规则卷曲结构,其中α-螺旋发生频率较高.实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)分析显示,该基因家族成员在高温、低温、干旱和盐胁迫下均有不同程度地响应,且在不同时间表达差异显著.以BrNHX02和BrNHX09对这4种胁迫的响应最为显著,表达量在处理72 h时均显著上调,可作为候选基因进一步验证其功能.

王雪花、韩佳、马济中、杨曦婷、满华丽、乔亚丽、高雪琴、胡琳莉

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甘肃农业大学园艺学院,甘肃兰州730070

NHX基因家族 亚细胞定位 荧光定量 胁迫 大白菜

甘肃农业大学省级大学生创新创业训练计划甘肃农业大学学生大学生创新创业计划甘肃省高等学校创新基金

S2020107330852020120072021A-058

2023

10.13345/j.cjb.220622

生物工程学报
中国科学院微生物研究所 中国微生物学会

生物工程学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.641
ISSN：1000-3061
年,卷(期)：2023.39(2)
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