生物技术通报2023,Vol.39Issue(2) :126-138.DOI:10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2022-0567

钩藤管家基因筛选及生物碱合成相关基因的表达分析

House-keeping Genes Screening and Expression Patterns Analysis of Genes Involved in Alkaloid Biosynthesis in Uncaria rhynchophylla

穆德添 万凌云 章瑶 韦树根 陆英 付金娥 田艺 潘丽梅 唐其
生物技术通报2023,Vol.39Issue(2) :126-138.DOI:10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2022-0567

钩藤管家基因筛选及生物碱合成相关基因的表达分析

House-keeping Genes Screening and Expression Patterns Analysis of Genes Involved in Alkaloid Biosynthesis in Uncaria rhynchophylla

穆德添 1万凌云 2章瑶 1韦树根 2陆英 1付金娥 2田艺 1潘丽梅 2唐其1
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作者信息

  • 1. 湖南农业大学园艺学院, 长沙 410128
  • 2. 广西壮族自治区药用植物园,南宁 510023
  • 折叠

摘要

为研究钩藤不同部位中最适管家基因与钩藤生物碱上游合成途径中关键酶基因的表达模式.以钩藤根、茎钩、叶片、蒴果为实验材料,通过RT-qPCR技术、GeNorm、NormFinder、Bestkeeper软件及△Ct程序、RefFinder在线网站分析了12个候选管家基因(18S、SAM、TUA、TUB、EF-1β、EF-1α、RNA L13、GAPDH、Actin6、PAL、CYP、cdc73)表达稳定性.结果表明,最适管家基因为SAM.再以SAM为管家基因,基于"基因组+转录组+代谢组"共表达分析筛选出钩藤生物碱上游合成途径中的15个重点候选相关基因(G8H、8-HGO、IS、CYP76A26、7-DLGT、7-DLH、LAMT、SLS、AS、AnPRT、IGPS、TSA、TSB、TDC、STR)进行表达分析,结果显示这些基因的表达量与含量趋势较为一致,很可能参与钩藤中TIAs的合成.

关键词

钩藤/实时荧光定量PCR/管家基因/吲哚萜类生物碱/关键酶基因/表达

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基金项目

湖南省教育厅重点项目(21A0138)

广西自然科学基金(2019GXNSFBA185026)

湖南省自然科学基金(2022JJ30305)

国家自然科学基金(81903752)

湖南农业大学园艺学科开放课题(2021YYXK002)

广西壮族自治区药用植物园基金(桂药基202013)

出版年

2023
生物技术通报
中国农业科学院农业信息研究所

生物技术通报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.505
ISSN:1002-5464
参考文献量13
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