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番茄青枯病抗性相关miRNA的鉴定与表达分析

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为理解番茄(Solanum lycopersicum)青枯病抗性响应miRNA与靶基因间的调控关系,对抗、感番茄自交系接种青枯菌(Ralstonia solanacearum)前后进行小RNA测序.结果在 8 个样本中共获得 112.76 M高质量数据,检测到 336 个miRNA,包括 193 个新miRNA.其中,31 个差异表达miRNA靶向调节 575 个基因的表达.556 个靶基因被注释到防御反应、植病互作、植物激素信号转导等代谢途径中.启动子除典型的转录起始TATA-box和CAAT-box,及与生物胁迫相关的W-box和TC-rich repeats,还存在激素、光、非生物胁迫、伤等响应元件.RT-qPCR验证发现 6 对miRNA-targets具有正-负、负-正和负-负 3 种番茄青枯病应答模式.这些结果初步揭示miRNA可以通过靶向基因表达响应番茄青枯病.
Identification and Expression Analysis of miRNA Related to Bacterial Wilt Resistance in Tomato

史建磊、宰文珊、苏世闻、付存念、熊自立

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温州科技职业学院浙南作物育种重点实验室,温州 325006

福建农林大学农学院,福州 350002

番茄 青枯菌 miRNA 靶基因 表达调控

浙江省农业新品种选育重大科技专项子课题温州市农业新品种选育协作组项目温州科技职业学院博士科研启动项目

2021C020652019ZX007-320183001

2023

10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2022-1241

生物技术通报
中国农业科学院农业信息研究所

生物技术通报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.505
ISSN：1002-5464
年,卷(期)：2023.39(5)
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