生物技术通讯2020,Vol.31Issue(2) :172-177.

基于数据挖掘分析POLR2A基因在脑胶质瘤的表达及意义

Data Mining Analysis of POLR2A Gene Expression and Prognostic Significance in Gliomas

李素芬 王唯斯 杨娜 梅雯 孙美涛 熊伟
生物技术通讯2020,Vol.31Issue(2) :172-177.

基于数据挖掘分析POLR2A基因在脑胶质瘤的表达及意义

Data Mining Analysis of POLR2A Gene Expression and Prognostic Significance in Gliomas

李素芬 1王唯斯 1杨娜 1梅雯 2孙美涛 3熊伟1
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作者信息

  • 1. 大理大学 基础医学院,云南 大理 671000
  • 2. 楚雄州人民医院 病理科,云南 楚雄 675000
  • 3. 杭州医学院 基础医学与法医学教研室,浙江 杭州 310053
  • 折叠

摘要

目的:基于数据挖掘分析POLR2A基因在低级别脑胶质瘤及正常脑组织中的表达情况,进一步探讨POLR2A基因对低级别脑胶质瘤患者的预后意义.方法:利用Oncomine和GEPIA数据库对POLR2A基因mRNA在正常脑组织和低级别脑胶质瘤组织中的表达进行分析;通过cBioportal分析POLR2A基因在低级别脑胶质瘤组织中的突变情况;利用Onco Lnc数据库对POLR2A基因的表达水平与低级别脑胶质瘤患者生存率做Kaplan-Meier生存分析;使用String-DB数据库探索真核生物表达调控过程中的POLR2A相关蛋白.结果:与正常脑组织相比,低级别脑胶质瘤组织中的POLR2A基因mRNA水平呈显著高表达(P≤0.05);POLR2A基因的表达水平与低级别脑胶质瘤患者的总生存时间无明显相关性;POLR2A基因在低级别脑胶质瘤组织中存在高突变率;真核生物RNA聚合酶POLR2E、POLR2F、POLR2G、POLR2K、POLR2L等与POLR2A有明显的相互作用.结论:数据库中荟萃了POLR2A基因在低级别脑胶质瘤组织中表达的相关信息,证实POLR2A基因在低级别脑胶质瘤组织中呈高表达.

关键词

数据挖掘/POLR2A/低级别脑胶质瘤

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基金项目

国家自然科学基金(81560458)

国家自然科学基金(31601155)

云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目(2017HB077)

云南省教育厅科学研究基金指导性项目(2016ZDX05)

云南省教育厅科学研究基金(2020Y0542)

出版年

2020
生物技术通讯
军事医学科学院生物工程研究所

生物技术通讯

CSTPCD
影响因子:0.385
ISSN:1009-0002
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