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基于数据挖掘分析POLR2A基因在脑胶质瘤的表达及意义

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目的:基于数据挖掘分析POLR2A基因在低级别脑胶质瘤及正常脑组织中的表达情况,进一步探讨POLR2A基因对低级别脑胶质瘤患者的预后意义.方法:利用Oncomine和GEPIA数据库对POLR2A基因mRNA在正常脑组织和低级别脑胶质瘤组织中的表达进行分析;通过cBioportal分析POLR2A基因在低级别脑胶质瘤组织中的突变情况;利用Onco Lnc数据库对POLR2A基因的表达水平与低级别脑胶质瘤患者生存率做Kaplan-Meier生存分析;使用String-DB数据库探索真核生物表达调控过程中的POLR2A相关蛋白.结果:与正常脑组织相比,低级别脑胶质瘤组织中的POLR2A基因mRNA水平呈显著高表达(P≤0.05);POLR2A基因的表达水平与低级别脑胶质瘤患者的总生存时间无明显相关性;POLR2A基因在低级别脑胶质瘤组织中存在高突变率;真核生物RNA聚合酶POLR2E、POLR2F、POLR2G、POLR2K、POLR2L等与POLR2A有明显的相互作用.结论:数据库中荟萃了POLR2A基因在低级别脑胶质瘤组织中表达的相关信息,证实POLR2A基因在低级别脑胶质瘤组织中呈高表达.
Data Mining Analysis of POLR2A Gene Expression and Prognostic Significance in Gliomas

李素芬、王唯斯、杨娜、梅雯、孙美涛、熊伟

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大理大学 基础医学院,云南 大理 671000

楚雄州人民医院 病理科,云南 楚雄 675000

杭州医学院 基础医学与法医学教研室,浙江 杭州 310053

数据挖掘 POLR2A 低级别脑胶质瘤

国家自然科学基金国家自然科学基金云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目云南省教育厅科学研究基金指导性项目云南省教育厅科学研究基金

81560458316011552017HB0772016ZDX052020Y0542

2020

生物技术通讯
军事医学科学院生物工程研究所

生物技术通讯

CSTPCD
影响因子:0.385
ISSN:1009-0002
年,卷(期):2020.31(2)
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