生物技术通讯2020,Vol.31Issue(4) :455-460.DOI:10.3969/j.issn.1009-0002.2020.04.014

恶性胸膜间皮瘤中EFEMP1基因mRNA的表达及其临床病理学意义

Expression of EFEMP1 mRNA in Malignant Pleural Meso⁃thelioma and its Clinicopathological Significance

杨娜 李彬 李素芬 王唯斯 自加吉 熊伟
生物技术通讯2020,Vol.31Issue(4) :455-460.DOI:10.3969/j.issn.1009-0002.2020.04.014

恶性胸膜间皮瘤中EFEMP1基因mRNA的表达及其临床病理学意义

Expression of EFEMP1 mRNA in Malignant Pleural Meso⁃thelioma and its Clinicopathological Significance

杨娜 1李彬 1李素芬 1王唯斯 1自加吉 2熊伟3
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作者信息

  • 1. 大理大学 基础医学院 生物化学与分子生物学教研室,云南 大理 671000
  • 2. 大理大学 基础医学院 病理学教研室,云南 大理 671000
  • 3. 大理大学 基础医学院 生物化学与分子生物学教研室,云南 大理 671000;云南省高校临床生物化学检验重点实验室,云南 大理 671000
  • 折叠

摘要

目的:探讨人表皮生长因子含纤蛋白样胞外基质蛋白1(EFEMP1)基因mRNA表达量与恶性胸膜间皮瘤(MPM)临床病理之间的相关性及其预后意义.方法:利用Oncomine数据库对非肿瘤组织与MPM组织中EFEMP1基因的mRNA表达量进行比较分析;采用R3.6.3软件下载美国公共癌症基因数据库(TCGA)中MPM数据集并分析EFEMP1基因mRNA表达的病理相关性;采用基因表达谱动态分析(GEPIA)构建Kaplan-Meier生存模型,探究EFEMP1基因mRNA表达量对MPM患者预后的影响;使用cBioportal进行EFEMP1基因相关性的可视化分析.结果:EFEMP1基因mRNA在正常组织中低表达,在MPM组织中高表达;EFEMP1基因mRNA表达水平与MPM的T分期(P=0.046)、病理类型(P=0.031)及组织学诊断类型(P=0.031)具有显著相关性;在MPM患者中,EFEMP1基因mRNA表达量与患者的总生存率和无疾病进展生存率均无显著相关性(logrank P>0.05).基因表达相关性分析结果表明,UGP2、RRAS2、ANXA3、UPK1B、ADH6、XPC与EFEMP1基因表达量呈显著性正相关(P<0.05),TCF4、NFATC4、SMTN与EFEMP1基因表达量呈显著性负相关(P<0.05).结论:EFEMP1基因有望作为MPM诊断和治疗的潜在靶点,但EFEMP1基因mRNA表达量不是判断MPM患者预后的有效指标.

关键词

恶性胸膜间皮瘤/人表皮生长因子含纤蛋白样胞外基质蛋白1(EFEMP1)基因/纤蛋白3/数据挖掘/病理意义

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基金项目

国家自然科学基金(81560458)

国家自然科学基金(31601155)

国家自然科学基金(31760331)

云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目(2017HB077)

云南省万人计划青年拔尖人才项目(2019)

云南省高校病理学与病理生理学硕士研究生导师团队项目(2019)

出版年

2020
生物技术通讯
军事医学科学院生物工程研究所

生物技术通讯

CSTPCD
影响因子:0.385
ISSN:1009-0002
参考文献量2
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