生物技术通讯2020,Vol.31Issue(4) :461-466.DOI:10.3969/j.issn.1009-0002.2020.04.015

基于Oncomine数据库分析COL5A2基因在胰腺癌中的表达及其临床意义

Expression of COL5A2 in Pancreatic Cancer and its Clini⁃cal Significance Based on Oncomine Database

李萍 刘怡茜
生物技术通讯2020,Vol.31Issue(4) :461-466.DOI:10.3969/j.issn.1009-0002.2020.04.015

基于Oncomine数据库分析COL5A2基因在胰腺癌中的表达及其临床意义

Expression of COL5A2 in Pancreatic Cancer and its Clini⁃cal Significance Based on Oncomine Database

李萍 1刘怡茜1
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作者信息

  • 1. 南京医科大学第一附属医院 肿瘤科,南京 210009
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摘要

目的:探讨COL5A2基因在胰腺癌中的表达及临床意义.方法:收集Oncomine和NCBI/GEO Profiles数据库中关于COL5A2的信息,对目前数据库中的资料进行二次分析,并对其在胰腺癌组织和正常胰腺组织中的表达进行荟萃分析,利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析COL5A2与胰腺癌患者预后的关系.结果:Oncomine数据库中共收集了417项不同类型的研究,其中COL5A2高表达有75项研究,低表达有3项研究.共有7项研究涉及COL5A2在胰腺癌组织与正常组织中的表达,包括178例样本,与正常组织相比,COL5A2在胰腺癌组织中高表达(P<0.05).NCBI/GEO Profiles数据库分析同样发现COL5A2在胰腺癌组织中高表达(P<0.05),与达沙替尼(dasatinib)敏感细胞株相比,达沙替尼耐药细胞株中COL5A2表达升高,进一步分析发现TGF-β处理48 h后COL5A2表达升高.Kaplan-Mei⁃er Plotter数据库分析表明COL5A2高、低表达组胰腺癌患者的总体生存率(OS)无统计学差异(HR=1.45,95%CI:0.96~2.18,P=0.077),但高表达组胰腺癌患者的无复发生存率(RFS)明显差于低表达组(HR=4.13,95%CI:1.46~11.72,P=0.0045).结论:基于Oncomine和NCBI/GEO Profiles数据库分析发现COL5A2在胰腺癌组织高表达,且与胰腺癌患者的无复发生存及达沙替尼耐药性密切相关,有望成为胰腺癌诊断和治疗的重要靶标.

关键词

胰腺癌/COL5A2/Oncomine数据库/NCBI/GEO/Profiles数据库/Kaplan-Meier/Plotter数据库

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出版年

2020
生物技术通讯
军事医学科学院生物工程研究所

生物技术通讯

CSTPCD
影响因子:0.385
ISSN:1009-0002
被引量4
参考文献量21
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