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核内RNA对真核细胞基因组三维高级结构的影响

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目的:研究核内RNA与真核细胞基因组三维结构的关系,并探讨核内RNA对染色体高级结构如拓扑相关结构域(TAD)和A/B区室的影响.方法:利用全基因组染色质构象捕获(Hi-C)技术对正常GM12878细胞和经过RNase处理的GM12878细胞进行染色质相互作用的检测.结果:经RNase处理后,染色质的三维高级结构在整体上变得松散,染色体之间的相互作用增强(秩和检验P<0.05),A/B区室发生改变,并且相比于所有染色体,X染色体在A/B区室上的变化更大.同时,核内RNA的去除也让TAD边界的强度有所减弱(Vilcox校验P<0.05).结论:核内RNA参与了真核细胞基因组三维高级结构的形成,并使TAD和A/B区室更加致密.
Effects of Intranuclear RNA on the Three-Dimensional Advanced Structure of Eukaryotic Genome

金加、沈文龙、李平、张彦、陈昭烈、赵志虎

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军事医学研究院 生物工程研究所,北京 100071

核内RNA 全基因组染色质构象捕获(Hi-C) 区室 TAD边界强度

国家自然科学基金青年项目

31900474

2020

10.3969/j.issn.1009-0002.2020.05.007

生物技术通讯
军事医学科学院生物工程研究所

生物技术通讯

CSTPCD
影响因子：0.385
ISSN：1009-0002
年,卷(期)：2020.31(5)
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