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杨树木质素合成酶CCR基因的序列分析及蛋白结构预测

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利用RT-PCR从欧美杨107次生木质部中克隆出一961bp 的CCR基因片段.通过生物信息学软件对该序列的核苷酸序列、拟翻译的氨基酸序列的疏水性、残基带电量及表面暴露区、蛋白质二级结构、亚细胞定位及三维结构等进行了初步分析预测.结果表明该CCR基因含一个编码301个氨基酸的完整开放阅读框,其成熟蛋白为亲水性的、主要存在于细胞膜,具有大多数植物CCR 蛋白普遍存在的KNWYCYGK 的保守性基序,其二级结构中共包含12个α螺旋,20个β折叠,11个卷曲,并构建了其三维结构图.
The sequence analysis and protein structure prediction of lignin biosynthesis CCR gene in poplar

赵文超、薛永常

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大连工业大学,生物与食品工程学院,辽宁,大连,116034

CCR 序列分析 蛋白结构预测

辽宁省自然科学基金辽宁省教育厅科研项目

2006214620040091

2009

生物信息学
哈尔滨工业大学

生物信息学

CSTPCDCSCD
影响因子：0.245
ISSN：1672-5565
年,卷(期)：2009.7(2)
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