山西大同大学学报(自然科学版)2023，Vol.39Issue(2) ：67-72.DOI:10.3969/j.issn.1674-0874.2023.02.014

探究CUL4B在结直肠癌患者来源的肿瘤类器官中调控miRNAs

Exploration of the Regulation of miRNAs by CUL4B in Colorectal Cancer Patient-derived Tumor Organoids

李彦军 王宇星 穆雅琴 鲍欣雨 刘杨青 何耀麒 肖冰帅 杨嘉凯 张年萍 郝大江
山西大同大学学报(自然科学版)2023，Vol.39Issue(2) ：67-72.DOI:10.3969/j.issn.1674-0874.2023.02.014
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探究CUL4B在结直肠癌患者来源的肿瘤类器官中调控miRNAs

Exploration of the Regulation of miRNAs by CUL4B in Colorectal Cancer Patient-derived Tumor Organoids

李彦军 1王宇星 2穆雅琴 1鲍欣雨 1刘杨青 1何耀麒 1肖冰帅 1杨嘉凯 1张年萍 1郝大江3
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作者信息

  • 1. 山西大同大学医学院免疫学研究所,山西大同,037009
  • 2. 山东大学基础医学院,山东济南,250012
  • 3. 大同市第三人民医院,山西大同,037008
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摘要

目的 探究CUL4B在肿瘤患者来源的结直肠癌肿瘤类器官中调控miRNAs.方法 利用干扰CUL4B的和其对照的PDOs样本,进行miRNA-seq,对差异miRNAs的靶基因进行KEGG和GO等分析.利用TargetScan和miRDB 2个数据库分别预测可能受CUL4B调控的并且评分≥85分的miRNAs,结合miRNA-seq差异miRNAs进行韦恩分析.结果 miRNA-seq结果显示共有41个差异miRNAs.TargetScan和miRDB两个数据库和测序数据韦恩分析发现miR495-3p、miR381-3p和miR148b-5p 3个共同交集的miRNAs.KEGG结果显示代谢通路富集的基因个数最多,溶酶体富集基因Q值最小.GO分析结果显示单有机体过程、蛋白质结合和细胞质富集基因最多.流式细胞仪检测发现干扰CUL4B的表达并不影响PDOs的细胞周期.结论 CUL4B可能是通过代谢通路和溶酶体2个信号通路调控miR495-3p、miR381-3p和miR148b-5p.

关键词

CUL4B/结直肠癌/肿瘤类器官/miRNAs

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基金项目

山西省基础研究计划青年项目(20210302123338)

山西省高等学校科技创新项目(2021L372)

山西省大学生创新创业训练计划(20220790)

山西大同大学博士科研启动项目()

山西大同大学产学研项目(2022019)

山西大同大学大学生创新创业项目(XDC2021115)

山西大同大学大学生创新创业项目(XDC2022109)

出版年

2023
山西大同大学学报(自然科学版)
山西大同大学

山西大同大学学报(自然科学版)

影响因子：0.271
ISSN：1674-0874
被引量1
参考文献量15
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