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microRNA在树鼩真菌性角膜炎中的调控网络及其生物学功能分析

Regulation network and biological function of microRNA in tree shrew fungal keratitis

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筛选树鼩真菌性角膜炎发病过程中差异表达的微小RNA (microRNA,miRNA)和信使RNA(mRNA),分析其靶基因的生物学功能及信号通路,为阐明真菌性角膜炎的免疫机制及筛选其抗真菌治疗的潜在靶点提供线索.通过茄病镰刀菌液显微注射至树鼬角膜基质,诱导真菌性角膜炎的发生;使用高通量测序技术检测茄病镰刀菌感染树鼬第7天、14天和30天的角膜组织miR-NA和mRNA表达谱,以自身未感染的眼角膜为对照;差异表达miRNAs的靶基因与差异表达mRNAs取交集构建miRNA-mRNA调控网络,采用实时荧光定量PCR进行验证;最后对靶基因进行GO和KEGG富集分析.结果 表明:在茄病镰刀菌感染树鼩角膜第7天、14天和30天,分别有78、56、41个mRNAs和70、63、20个miRNAs显著性差异表达,其中有29个mRNAs和14个miRNAs在感染第7天、14天和30天均显著性差异表达,Has-miR-214-3p和Has-miR-149-5p处于调控网络的关键节点.GO和KEGG富集分析发现,显著性差异表达的mRNAs和miRNAs靶基因主要参与免疫反应和炎症反应,涉及Toll-like受体、NOD-like受体、NF-kB和TNF信号通路.研究结果明确了树鼩真菌性角膜炎存在miRNA-mRNA差异表达基因谱,Has-miR-214-3p、Has-miR-149-5p与树鼩真菌性角膜炎相关,可作为真菌性角膜炎发生和预后评价的潜在生物学标志物.

贾杰、黎晓慧、黄鑫、李明学、施梅言、邱丹丹、仝品芬、代解杰

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中国医学科学院/北京协和医学院医学生物学研究所,云南省眼科疾病防治研究重点实验室,中国医学科学院医学生物学研究所实验树鼩标准化与应用研究省创新团队,云南昆明650118

树鼬 真菌性角膜炎 microRNA 基因调控网络

云南省眼科疾病防治研究重点实验室中央高校基本科研业务费专项资金云南省科技人才和平台计划项目

2017DG00833320181622017HC019

2020

陕西师范大学学报(自然科学版)
陕西师范大学

陕西师范大学学报(自然科学版)

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.563
ISSN：1672-4291
年,卷(期)：2020.48(5)
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