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基于SSR标记的野生黑木耳种质资源遗传多样性研究

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野生黑木耳(Auricularia heimuer)种质资源丰富,具有许多优异的特性,是重要的遗传育种材料,利用基于黑木耳全基因组序列设计的30对SSR引物(24对为特异性强的引物,分布于已经构建的黑木耳遗传连锁图谱的8个连锁群上,其余6对为多态性好的引物)对收集自国内黑木耳主要分布地区(云南、吉林、黑龙江等8个省)、国外黑木耳主要分布地区(朝鲜、俄罗斯)的72个野生菌株进行遗传多样性分析.结果表明:30对SSR引物共检测到211个等位基因位点,每对引物扩增出的位点数为5~12个,多态性位点丰富,比率高达100%;30对SSR引物的平均Shannon's信息指数、观测杂合度、期望杂合度和多态性信息含量分别为1.532、0.469、0.722和0.717;供试菌株间遗传相似系数为0.056~0.951,有75.16%菌株间相似系数小于0.5;在相似系数为0.718处,可将菌株分为7个类群,其中JAUAH 214(吉林省)、JAUAH 251(云南省)、JAUAH 282(吉林省)、JAUAH 301(云南省)和JAUAH 386(朝鲜)均独立成群,菌株间差异极大.筛选出条带清晰、多态性信息含量高、能完全区分72个供试菌株,并可用于二维码指纹图谱构建的SSR核心引物9对.研究结果为黑木耳遗传育种及种质资源保护、智能化管理提供参考.
Genetic Diversity of Wild Auricularia heimuer Germplasm Resources Based on SSR Markers

尹莉岚、姚方杰、石晨阳、鲁丽鑫、王婷、刘威

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吉林农业大学园艺学院,吉林长春130118

食药用菌教育部工程研究中心,吉林长春130118

野生黑木耳 种质资源 SSR标记 遗传多样性 核心引物

国家体系产业技术体系黑木耳品种改良岗位专项

CARS-20

2022

食用菌学报
上海市农业科学院食用菌研究所,上海市农业科学院农业科技信息研究所

食用菌学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.771
ISSN:1005-9873
年,卷(期):2022.29(4)
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