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鸡(土从)菌基因组测序和比较基因组分析

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  • 万方数据
对采集自四川省内江市东兴区高桥村灌木林的鸡(土从)菌(Termitomyces albuminosus)进行基因组测序、组装、基因功能注释、碳水化合物酶(carbohydrate-active enzyme,CAZy)预测、进化树构建、同源序列比对及简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记开发和PCR扩增验证的研究工作.结果表明:鸡(土从)菌全基因组共存在1.71×103个蛋白质编码基因,平均长度为1.65×103bp;CAZy功能注释聚类分析表明,黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)、内华达古白蚁(Zootermopsis nevadensis)、面包酵母(Saccharomyces cerevisiae)和裂体吸虫(Schistosoma mansoni)聚类到同一大组,鸡(土从)菌与其他物种聚类到另一大组,且与刺芹侧耳(Pleurotus eryngii)和糙皮侧耳(P.ostreatus)聚类到更小分组;进化树分析表明,蚁巢伞属真菌与常见的栽培食用菌之间存在一定的进化距离,与金针菇(Flammulina velutipes)、猴头菌(Hericium erinaceus)和香菇(Lentinula edodes)的进化距离较近;采用SSR标记对收集的鸡(土从)菌进行分析,发现一地域分布的鸡(土从)菌在遗传上存在较高的相似性.
Genome Sequencing and Comparative Genomic Analysis of Termitornyces albuminosus

黎勇、孙明伟、杜婉婷、邓佳、陈慧、史典义

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内江师范学院生命科学学院,四川内江641100

沱江流域特色农业资源四川省科技资源共享服务平台,四川内江641100

鸡(土从)菌 白蚁 基因组组装 比较基因组 简单重复序列

X2021089

2022

10.16488/j.cnki.1005-9873.2022.06.001

食用菌学报
上海市农业科学院食用菌研究所,上海市农业科学院农业科技信息研究所

食用菌学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.771
ISSN：1005-9873
年,卷(期)：2022.29(6)
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