时珍国医国药2024,Vol.35Issue(3) :648-651.DOI:10.3969/j.issn.1008-0805.2024.03.31

基于psbA-trnH标记的红花龙胆野生居群遗传多样性研究

任得强 王仕梅 李梅 魏升华
时珍国医国药2024,Vol.35Issue(3) :648-651.DOI:10.3969/j.issn.1008-0805.2024.03.31

基于psbA-trnH标记的红花龙胆野生居群遗传多样性研究

任得强 1王仕梅 1李梅 1魏升华1
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作者信息

  • 1. 贵州中医药大学药学院,贵州贵阳 550025
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摘要

目的 对贵州、云南等18个产地111份红花龙胆分子样品进行检测,为红花龙胆的分类鉴别及遗传研究提供参考.方法 研究采用叶绿体基因psbA-trnH序列进行扩增并测序,进行序列差异分析、单倍型分析及遗传多样性分析.结果 111条红花龙胆叶绿体基因psbA-trnH序列扩增成功率和测序成功率分别为100.00%和94.90%;psbA-trnH序列差异分析结果表明,保守位点337个,变异位点24个,简约信息位点24个,二倍简并位点87个,四倍简并位点26个;遗传距离分析结果表明,居群间遗传距离变化范围是0~0.032,平均遗传距离为0.017;18个红花龙胆居群的序列共产生多态(分离)位点数S为9,突变总数(Eta)为11,单倍型数(h)为7个,单倍型(基因)多样性(Hd)为0.667,核苷酸多样性(Pi)为0.012,单倍型多样性方差(Vh)值0.001、单倍型多样性标准差(Sh)值0.032,遗传分化系数为0.494,基因流为0.200;经聚类分析,psbA-trnH序列易于将红花龙胆与外类群区分,且将红花龙胆18个野生居群聚为两类.结论 叶绿体基因psbA-trnH序列可应用于红花龙胆种质资源的遗传多样性研究中,不同产地红花龙胆遗传变异丰富,在进化上存在一定的地域性特征.

关键词

红花龙胆/psbA-trnH序列/野生居群/遗传多样性

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出版年

2024
时珍国医国药
时珍国医国药杂志社

时珍国医国药

北大核心
影响因子:0.887
ISSN:1008-0805
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