时珍国医国药2024,Vol.35Issue(7) :1633-1635.DOI:10.3969/j.issn.1008-0805.2024.07.21

基于GSEA阐释补肺方抑制巨噬细胞炎症反应配伍机制

关庆洲 赵鹏 田燕歌 李康沉 彭岩 郭弘妍 李建生
时珍国医国药2024,Vol.35Issue(7) :1633-1635.DOI:10.3969/j.issn.1008-0805.2024.07.21

基于GSEA阐释补肺方抑制巨噬细胞炎症反应配伍机制

关庆洲 1赵鹏 1田燕歌 1李康沉 2彭岩 3郭弘妍 4李建生5
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作者信息

  • 1. 河南中医药大学呼吸疾病中医药防治省部共建协同创新中心,河南省中医药防治呼吸病重点实验室,河南郑州 450046;河南中医药大学中医药科学院,河南郑州 450046
  • 2. 河南中医药大学呼吸疾病中医药防治省部共建协同创新中心,河南省中医药防治呼吸病重点实验室,河南郑州 450046
  • 3. 生物芯片北京国家工程研究中心,北京 102200
  • 4. 生物芯片北京国家工程研究中心,北京 102200;北京博奥晶方生物科技有限公司,北京 102200
  • 5. 河南中医药大学呼吸疾病中医药防治省部共建协同创新中心,河南省中医药防治呼吸病重点实验室,河南郑州 450046;河南中医药大学第一附属医院,河南郑州 450000
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摘要

目的 利用脂多糖(LPS)诱导的巨噬细胞炎症反应模型和基因集富集分析(GSEA)方法,从通路水平探析补肺方及其配伍干预慢性阻塞性肺疾病的作用机制.方法 通过LPS诱导巨噬细胞建立炎症反应模型,给予补肺方所含中药分别处理,并进行高通量测序得到相应的基因表达谱数据.通过GSEA方法,筛选在巨噬细胞炎症反应样本中显著扰动的通路,基于富集评分(NES)鉴定每味中药处理后失调方向发生显著逆转的通路,揭示补肺方及其配伍对炎症的干预机制.结果 以得到的244条巨噬细胞炎症反应相关通路为基础,结果显示补肺方显著逆转通路的NES为-720.02,其中补肺气配伍为-163.72,止咳化痰配伍为-369.75,活血配伍为-186.55;补肺方可显著逆转158条通路(逆转率为64.75%),其中补肺气配伍、止咳化痰配伍、活血配伍显著逆转的通路分别为87、133、100条,逆转率为35.66%、54.51%、40.98%.Regulation of T cell mediated immunity等51条通路在三个配伍中均被显著逆转.Positive regulation of interleukin 12 produc-tion 等通路在补肺气配伍中特异逆转.Negative regulation of viral entry into host cell等通路在止咳化痰配伍中特异逆转.Chronic inflammatory response等通路在活血配伍中特异逆转.结论 补肺方各配伍逆转巨噬细胞炎症反应相关通路的数量及强度均依次为止咳化痰、活血、补肺气配伍.补肺方可通过各配伍逆转regulation of T cell mediated immunity等共性通路及positive regulation of interleukin 12 production等特异性通路抑制炎症反应.

关键词

补肺方/慢性阻塞性肺疾病/通路/巨噬细胞/炎症反应/基因集富集分析

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基金项目

国家中医药传承与创新"百千万"人才工程—岐黄工程首席科学家项目(国中医药人教函[2021]7号)

国家自然科学基金面上项目(81973822)

博士后创新人才支持计划(BX20200115)

国家自然科学基金青年基金(82305018)

出版年

2024
时珍国医国药
时珍国医国药杂志社

时珍国医国药

北大核心
影响因子:0.887
ISSN:1008-0805
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