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铁皮石斛DoPLR基因的克隆、序列分析及表达分析

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目的 进一步阐明铁皮石斛(Dendrobium officinale)中木脂素生物合成的分子调控机制，克隆铁皮石斛木脂素合成关键酶基因DoPLR，分析其序列特征及表达模式。方法 根据NCBI中铁皮石斛PLR基因序列设计特异引物，利用PCR技术克隆铁皮石斛DoPLR基因，利用生物信息学软件分析DoPLR基因及编码蛋白的结构特征。利用荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测DoPLR基因在铁皮石斛不同组织部位、不同非生物胁迫、不同激素处理等情况下的表达模式。结果 克隆获得铁皮石斛DoPLR基因，该基因的开放阅读框(ORF)长度为933bp，编码310个氨基酸，蛋白相对分子质量和等电点分别为36。4 KDa和6。54;该蛋白含有NAD(P)+结合结构域，为亲水性蛋白，可能在细胞核中发挥作用，有29个磷酸化位点;该蛋白二级结构含有37。42％的α-螺旋、7。42％的β-折叠、36。77％的无规则卷曲和18。39％的延伸链;聚类分析表明该蛋白与亚麻LuPLR蛋白聚在一个分支上;互作蛋白分析表明丝氨酸苏氨酸蛋白激酶、转录因子bHLH63等蛋白可能与该蛋白发挥作用密切相关;qRT-PCR结果表明，DoPLR基因在不同组织部位、不同激素处理、不同非生物胁迫下的表达模式均存在差异，推测该基因可能参与铁皮石斛对非生物胁迫和激素的响应。结论 克隆获得了铁皮石斛DoPLR基因，分析了其序列特征和表达模式，为深入研究DoPLR基因的功能和铁皮石斛木脂素生物合成分子机制奠定基础。

于莹、陈宏宇、彭松平、杨奕樱

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贵州中医药大学基础医学院,贵州贵阳 550025

贵州中医药大学分子诊断研究中心,贵州贵阳 550025

贵州中医药大学药学院,贵州贵阳 550025

铁皮石斛 木脂素 PLR基因 序列分析 表达分析

贵州省基础研究计划(自然科学类)

黔科合基础-ZK[2021]一般521

2024

10.3969/j.issn.1008-0805.2024.07.63

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ISSN：1008-0805
年,卷(期)：2024.35(7)