目的:利用高通量测序数据构建坏死性凋亡相关的非编码RNAs(miRNAs)在肾透明细胞癌(Clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)预后风险模型,为预测患者生存提供指导,此外还研究了下游分子机制、分子表达以及组织样本验证.方法:本研究利用高通量二代测序数据分析肾透明细胞癌坏死性凋亡相关miRNAs表达及临床信息,通过Cox比例风险回归分析来构建一个预后相关多分子miRNAs模型.分析差异的miRNA-mRNA-lncRNA绘制生存曲线探讨预后价值,对靶基因功能富集分析,以及蛋白互作、lncRNA共表达来探索坏死性凋亡相关miRNA潜在的作用机制.应用实时荧光定量PCR(Quantitative real-time PCR,qPCR),在20个组织样本中检测miRNAs表达水平.结果:通过测序数据差异分析得到9个坏死性凋亡相关miRNAs,确定3个最佳预后坏死性凋亡相关的miRNAs(miR-425-5p,miR-223-3p和miR-7-5p).生存分析表明高风险组预后较差.通过Nomogram,可视化评估模型,风险评分可以作为独立预后因子.此外,通过调查可发现,坏死性凋亡miRNAs下游靶基因GO和KEGG通路富集与调节干细胞多能性的信号通路、MAPK信号通路有关.结论:坏死性凋亡相关miRNAs预后风险模型可以有效地指导肾透明细胞癌患者分层,对未来临床判断预后提供了有力的参考信息.此外,坏死性凋亡miRNAs下游靶基因NRAS、BEX4,及相关lncRNA为肾透明细胞癌中的进一步下游分子机制的研究提供生物信息学依据.
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