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实验室养殖条件下麦穗鱼(Pseudorasbora parva)eDNA浓度与生物量相关性曲线的拟合与比较分析

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为探究实验室养殖条件下麦穗鱼(Pseudorasbora parva)eDNA浓度与其生物量间关系,根据麦穗鱼线粒体COⅠ基因序列设计特异性引物,通过实时荧光定量PCR(qPCR),得到qPCR标准曲线,采用线性、指数和对数3种模型对麦穗鱼生物量与eDNA浓度的相关性曲线进行拟合和比较分析.结果表明:基于CO I基因设计的引物对麦穗鱼DNA具有特异性扩增,扩增效率为90.94％;qPCR的阈值循环数(Cycle threshold,Ct值)与已知浓度或拷贝数的样品(标准品)间呈现良好的线性关系(R2=0.995 2),说明标准品的拷贝数与Ct值之间相关的可信度较好.通过3种曲线进一步拟合比较分析显示:线性模型为麦穗鱼生物量与eDNA浓度间的最佳拟合模型,其R2高达0.933 8,y=72.087x+81.978.这表明在本试验条件下,eDNA浓度与麦穗鱼生物量呈正相关性.
Fitting and Comparative Analysis of the Correlation Curve Between the Environmental DNA Concentra-tion and Biomass of Pseudorasbora parva under Laboratory Rearing Conditions

郭娟、曾炳、郑羽晨、赵雨双、钟清

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西华师范大学生命科学学院,四川南充637000

eDNA浓度 生物量 麦穗鱼

2023

10.3969/j.issn.1006-6500.2023.06.008

天津农业科学
天津农业科学院信息研究所

天津农业科学

影响因子：0.705
ISSN：1006-6500
年,卷(期)：2023.29(6)
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