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叠氮溴化丙锭筛选环境活性微生物的原理及其应用

Principle of propidium monoazide in screening viable microorganisms from environmental samples and its application

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环境微生物总DNA主要来源于游离DNA以及活性和非活性微生物群.因此,单纯基于环境微生物总DNA的直接研究技术可能无法反映出环境中真实的活性微生物群落结构及组成,极易造成微生物丰度及群落多样性的高估,急需建立有效可行的活性微生物筛选方法.叠氮溴化丙锭(Propidium monoazide,PMA)是一种能够不可逆地共价结合死细胞DNA和胞外DNA(统称为relic DNA)的光敏性核酸染料,致使relic DNA被钝化,不能完成PCR扩增.基于此,结合后续荧光定量PCR和高通量测序等分子生物学技术,可快速、准确且高效地筛选区分出环境样本中的活性微生物类群.本文针对近几年关于PMA染料法在底泥、土壤和水体等常见环境样品中的应用研究结果进行综述,并探讨了目前PMA染料法应用中存在的问题,提出了相应的改进和完善对策,为深入研究复杂环境样品活性微生物类群及其结构功能提供了新思路.

胡晓婧、白鑫、曲娟娟、刘俊杰、孔令辉、王光华

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中国科学院 东北地理与农业生态研究所 黑土区农业生态重点实验室, 黑龙江 哈尔滨150081

东北农业大学 资源与环境学院, 黑龙江 哈尔滨150030

叠氮溴化丙锭 环境微生物 活性细胞检测 qPCR 高通量测序

41907035ZD2018009

2021

10.11689/j.issn.2095-2961.2021.03.007

土壤与作物
中国科学院东北地理与农业生态研究所

土壤与作物

CSTPCD
影响因子：0.623
ISSN：2095-2961
年,卷(期)：2021.10(3)
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