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毛茛中与苯丙烷生物合成途径相关的1R-MYB类转录因子的鉴定与分析

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1R-MYB家族在植物生长发育、抗胁迫、次生代谢物合成中具有重要的调控作用.本研究基于毛茛(Ranunculus japonicus Thunb.)的全长转录组测序数据库,分析了其1R-MYB家族成员的基序、系统进化关系、表达特性、空间结构及功能.结果共鉴定出221个1R-MYB基因,其中18个通过KEGG富集到苯丙烷生物合成途径,可能调控此途径中的过氧化物酶.研究结果为深入探究毛茛1R-MYB转录因子调控苯丙烷的生物合成机制奠定了基础.
Identification and analysis of 1R-MYB transcription factors regulating the phenylpropane biosynthesis pathway in Ranunculus japonicus Thunb.
The 1R-MYB family plays a crucial role in plant growth,development,stress resistance,and se-condary metabolite synthesis.A full-length transcriptome database for three different tissues of Ranunculus japonicus Thunb.was constructed using PacBio isoform sequencing and DNA nanoball sequencing.In this study,members of the 1R-MYB family were identified in the full-length transcriptome database of R.japonicus.Their motifs,family evolution,expression patterns,spatial structure,and functions were analyzed.In total,221 MYB-related genes were identified at the transcriptome level,with 18 1R-MYB transcription factors(TFs)found to be enriched in the phenylpropanoid biosynthesis pathway based on KEGG analysis,potentially regu-lating peroxidase activity.Overall,this study provides a foundation for further exploration of the regulatory functions of 1R-MYB TFs in secondary metabolite biosynthesis in R.japonicus.

Ranunculus japonicusTranscription factorsFull-length transcriptome1R-MYBPhenyl-propanoid biosynthesis

樊金世博、钟欣欣、单婷玉、张京晶、王郅炜、吴家文

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安徽中医药大学研究生院,合肥 230012

安徽中医药大学科研实验中心,新安医学教育部重点实验室,合肥 230038

安徽省中医药科学院,合肥 230012

安徽道地中药材品质提升协同创新中心,合肥 230012

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毛茛 转录因子 全长转录组 1R-MYB 苯丙烷生物合成途径

国家重点研发计划项目安徽省自然科学基金项目安徽省高等学校科学研究项目

2017YFC17016002008085MH2682022AH050474

2024

植物科学学报
中国科学院武汉植物园, 湖北省植物学会

植物科学学报

CSTPCD北大核心
影响因子:1.934
ISSN:2095-0837
年,卷(期):2024.42(4)