[目的]应用生物信息学分析方法对子宫平滑肌肉瘤(uterine leiomyosarcoma,ULMS)基因表达谱芯片进行分析,从分子水平探究ULMS的发病机制.[方法]从GEO数据库下载ULMS基因芯片数据,利用在线分析工具iDEP.91筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并对DEGs进行基因本体论(gene ontology,GO)及京都基因和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析.通过String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用分析,利用Cytoscape及其插件cytoHubba寻找关键基因(Hub基因).[结果]共筛选出209个DEGs,包括159个上调基因和50个下调基因.富集分析发现,DEGs主要涉及细胞周期、染色体分离、细胞分裂、DNA复制、P53信号通路等过程.通过String分析发现,包括AURKA、NCAPG、CCNB1、AURKB和CDCA8等在内的10个基因处于核心位置.[结论]AURKA、NCAPG、CCNB1、AURKB和CDCA8等基因可能在ULMS发生发展过程中起到关键作用,抑制这些基因的表达有可能成为疾病治疗的新思路.
Bioinformatics analysis of core genes associated to uterine leiomyosarcoma
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