武警后勤学院学报(医学版)2021,Vol.30Issue(4) :27-31.

子宫平滑肌肉瘤相关核心基因的生物信息学分析

Bioinformatics analysis of core genes associated to uterine leiomyosarcoma

霍莉莉 徐朋朋 冯义伶 沈春燕 曲雅静 任贵兵
武警后勤学院学报(医学版)2021,Vol.30Issue(4) :27-31.

子宫平滑肌肉瘤相关核心基因的生物信息学分析

Bioinformatics analysis of core genes associated to uterine leiomyosarcoma

霍莉莉 1徐朋朋 1冯义伶 1沈春燕 1曲雅静 1任贵兵1
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作者信息

  • 1. 武警特色医学中心肿瘤科,天津300162
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摘要

[目的]应用生物信息学分析方法对子宫平滑肌肉瘤(uterine leiomyosarcoma,ULMS)基因表达谱芯片进行分析,从分子水平探究ULMS的发病机制.[方法]从GEO数据库下载ULMS基因芯片数据,利用在线分析工具iDEP.91筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并对DEGs进行基因本体论(gene ontology,GO)及京都基因和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析.通过String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用分析,利用Cytoscape及其插件cytoHubba寻找关键基因(Hub基因).[结果]共筛选出209个DEGs,包括159个上调基因和50个下调基因.富集分析发现,DEGs主要涉及细胞周期、染色体分离、细胞分裂、DNA复制、P53信号通路等过程.通过String分析发现,包括AURKA、NCAPG、CCNB1、AURKB和CDCA8等在内的10个基因处于核心位置.[结论]AURKA、NCAPG、CCNB1、AURKB和CDCA8等基因可能在ULMS发生发展过程中起到关键作用,抑制这些基因的表达有可能成为疾病治疗的新思路.

关键词

子宫平滑肌肉瘤/差异表达基因/生物信息学

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出版年

2021
武警后勤学院学报(医学版)
武警后勤学院

武警后勤学院学报(医学版)

CSTPCD
影响因子:0.483
ISSN:2095-3720
参考文献量33
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