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应用铁死亡相关基因构建结直肠癌预后评估模型

A Novel Signature Model Based on Ferroptosis-related Genes for Predicting the Prognosis of Colorec-tal Carcinoma

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目的:应用铁死亡相关基因(FRGs)构建结直肠癌(CRC)预后评估模型.方法:分别从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载647例CRC患者资料,美国国家生物技术信息中心(NCBI)高通量基因表达(GEO)数据库下载556例CRC患者资料,GeneCards和铁死亡基因数据库下载774个与铁死亡相关的基因(FRGs).通过风险回归模型(Cox模型)筛选出了 14个与铁死亡相关的预后分子,通过Lasso回归建立铁死亡相关的预后模型,采用生存曲线分析(Kaplan-Meier分析)和受试者工作特征(ROC)曲线评估该模型的预测价值.结果:建立一个由11个基因组成的与铁死亡相关的CRC预后评估模型,可用于预测CRC患者的生存概率.结果表明高风险组患者预后较差.在TCGA数据库中,CRC患者1年、3年和5年ROC曲线下的面积(AUC)分别为0.756、0.774和0.782.在GEO数据库中,CRC患者1年、3年和5年AUC分别为0.767、0.744、0.726.FRGs预测模型的风险评分是CRC患者预后的独立预测因素(P<0.01).结论:本研究构建了 11个与铁死亡相关基因的CRC预后评估模型,该模型可为患者的个体化治疗和预后评估提供参考.
Objective:To use the ferroptosis-related genes(FRGs)to create a prognostic prediction model for CRC(colorectal cance)patients.Method:Download 647 cases of CRC patient data from the the cancer genome atlas(TCGA)database,556 cases of CRC patient data from the NCBI Gene expression omnibus(GEO)database,and 774 ferroptosis-related genes(FRGs)from GeneCards and the ferroptosis gene database.To discover prognostic markers and build the prognostic model,the least absolute shrinkage and selection operator(Lasso)regression analysis was utilized.We assessed the prognostic significance of the model by employing Kaplan-Meier analysis and the receiver operating characteristic curve(ROC)evaluation.Results:A prognostic model comprising 11 ferroptosis-related genes was developed.This model demonstrates a high level of accuracy in predicting outcomes and assessing im-mune responses in CRC.Based on the analysis of the ROC curve,patients belonging to the high-risk group exhibi-ted an unfavourable prognosis.The model achieved area under the curve values were 0.756,0.774,and 0.782 at 1,3,and 5 years,respectively.In the GEO database,the areas under the ROC for the CRC patients in 1,3,and 5 years were 0.767,0.744,and 0.726,respectively.In CRC,the risk score of predictive models for ferroptosis-re-lated gene biomarkers might serve as an independent prognostic factor(P<0.01).Conclusion:This research pro-poses a prediction model employing 11 ferroptosis-related genes that may help personalise treatment and evaluate CRC patients'prognoses.

Colorectal carcinomaFerroptosisPrognostic mode

魏菁菁、邓次妮、曾志武、傅冬梅、韩江龙、付振明、刘莉

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中国人民解放军解放军中部战区总医院检验科,武汉 430014

南方科技大学第一附属医院、深圳市人民医院心血管疾病诊疗中心,深圳 518001

深圳大学总医院普通外科,深圳 518071

武汉大学人民医院肿瘤中心,武汉 430060

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结直肠癌 铁死亡 预后模型

湖北省自然科学基金指导性项目

2022CFC062

2024

微循环学杂志
武汉大学人民医院,中国病理生理学会微循环专业委员会

微循环学杂志

CSTPCD
影响因子:0.969
ISSN:1005-1740
年,卷(期):2024.34(2)
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