首页|小黑杨RAV1与RAV2基因的克隆与表达分析

小黑杨RAV1与RAV2基因的克隆与表达分析

Cloning and expression analysis of PsnRAV1 and PsnRAV2 in Populus × xiaohei T.S.Hwang et Liang

扫码查看
[目的]克隆小黑杨(Populus×xiaohei T.S.Hwang et Liang)RAV1和RAV2基因,分析这2个基因在非生物胁迫下的表达模式,为进一步研究小黑杨基因功能提供理论依据.[方法]以抗逆性强的小黑杨根为试材,克隆2个RAV家族成员.利用生物信息学方法对小黑杨2个RAV基因的理化性质、保守基序、保守结构域、系统进化进行分析,并采用半定量RT-PCR方法探讨这2个基因在小黑杨顶芽、叶、木质部、韧皮部、根、第1~14片叶、第1~11茎节中的表达情况,以及在CdCl2、NaCl、NaHCO3、PEG和ABA胁迫下的表达特性.[结果]从小黑杨中克隆出2个RAV基因,命名为PsnRAV1和PsnRAV2.PsnRAV1编码405个氨基酸,预测分子质量约为99.46 ku,等电点5.06,不存在信号肽;PsnRAV2编码407个氨基酸,预测分子质量约为99.33 ku,等电点5.06,存在信号肽;2个基因均位于细胞核上.保守结构域和保守基序分析结果表明,小黑杨RAV蛋白具有RAV家族特有的AP2和B3这2个保守蛋白结构域,基序1、2、3是构成2个结构域的主要基序.系统进化分析表明,20种植物的RAV蛋白分为3组,其中PsnRAV1和PsnRAV2与毛果杨(Populus trichocarpa)RAV同源性很高.半定量RT-PCR分析结果显示,2个PsnRAVs基因在小黑杨的顶芽、叶、木质部、韧皮部和根中均有表达;且随着叶和茎的发育,2个基因的表达量均呈现升高的趋势.在CdCl2、NaCl、NaHCO3模拟的重金属及盐胁迫下,2个基因的表达模式虽不相同,但在根部均受到诱导;在PEG模拟的干旱胁迫下,PsnRAV1和PsnRAV2在叶片和根部均有响应,其中在根部受到的诱导更为明显,尤以PsnRAV2的表达更为显著;此外,PsnRAV1和PsnRAV2也受到ABA的诱导,其在叶中的表达量在初期表现为上升,而后期下降.[结论]2个PsnRAVs基因与小黑杨的抗逆性密切相关,可能参与了小黑杨的非生物胁迫应答,其中PsnRAV2在胁迫下的作用更为显著.

Populus ×xiaohei T.S.Hwang et LiangRAVbioinformatticsabiotic stressgene expres-sion analysistree genetic breeding

靳春慧、文小卉、刘羽婷、李月、王丽丽、刘立洋、董新宇、李慧玉

展开 >

林木遗传育种国家重点实验室,东北林业大学林学院,黑龙江哈尔滨150040

小黑杨 RAV 生物信息学 非生物胁迫 基因表达分析 林木遗传育种

国家转基因生物新品种培育科技重大专项东北林业大学大学生创新项目

2018ZX08020002201910225527

2023

西北农林科技大学学报(自然科学版)
西北农林科技大学

西北农林科技大学学报(自然科学版)

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.893
ISSN:1671-9387
年,卷(期):2023.51(9)
  • 1
  • 8