西北植物学报2020,Vol.40Issue(1) :35-42.

甘薯草甘膦抗性基因EPSPS克隆和序列分析

Cloning and Expression Analysis of Glyphosate Resistance Gene EPSPS in Sweet Potato

陈颖芳 周安琪 朱宏波
西北植物学报2020,Vol.40Issue(1) :35-42.

甘薯草甘膦抗性基因EPSPS克隆和序列分析

Cloning and Expression Analysis of Glyphosate Resistance Gene EPSPS in Sweet Potato

陈颖芳 1周安琪 1朱宏波1
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作者信息

  • 1. 广东海洋大学农学院,广东湛江524000
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摘要

EPSPS基因编码5-烯醇式丙酮酰莽草酸-3-磷酸合成酶,该酶是芳香族氨基酸合成的关键酶,该基因在细菌、真菌、藻类和植物中被广泛克隆和研究.EPSPS酶是草甘膦除草剂的靶点酶,过量表达EPSPS基因可以提高作物的草甘膦抗性.该研究根据甘薯基因组数据库设计引物,以‘广薯87’为材料提取RNA,通过RT-PCR方法扩增甘薯IbEPSPS基因,测序后进行生物信息学分析和表达分析.结果 表明:(1)成功克隆获得甘薯IbEPSPS基因,该基因全长CDS为1 569 bp,编码522个氨基酸,其中在第98~113、173~183位氨基酸序列具有2个EPSPS的保守结构域.(2)系统进化树分析结果表明,甘薯IbEPSPS基因与三裂叶薯(Jpomoea triloba)、打碗花(Calystegia hederacea)、田旋花(Convolvulus arvensis)和牵牛(Ipomoea nil)聚在一类,其中与三裂叶薯的亲缘关系最近.(3)实时荧光定量PCR分析结果表明,甘薯IbEPSPS基因在茎、叶和茎尖表达量较高,同时受到草甘膦胁迫后IbEPSPS基因表达量提高.该研究结果为进一步探讨甘薯IbEPSPS基因的功能及甘薯对草甘膦的耐药性机制奠定了基础.

关键词

甘薯/草甘膦抗性基因/基因克隆

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基金项目

NSFC-广东联合基金(U1701234)

出版年

2020
西北植物学报
西北农林科技大学,陕西省植物学会

西北植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.031
ISSN:1000-4025
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