西北植物学报2020,Vol.40Issue(3) :413-424.

基于cpDNA非编码序列的北沙柳遗传多样性分析

Genetic Diversity of Salix psammophila Based on cpDNA Non-coding Sequence

李娅翔 路东晔 郝蕾 张国盛 宁静 乌兰娜日 阿拉腾苏和
西北植物学报2020,Vol.40Issue(3) :413-424.

基于cpDNA非编码序列的北沙柳遗传多样性分析

Genetic Diversity of Salix psammophila Based on cpDNA Non-coding Sequence

李娅翔 1路东晔 1郝蕾 2张国盛 1宁静 3乌兰娜日 4阿拉腾苏和5
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作者信息

  • 1. 内蒙古农业大学 林学院,呼和浩特 010019
  • 2. 内蒙古财经大学,呼和浩特 010070
  • 3. 内蒙古林业科学研究院,呼和浩特010010
  • 4. 鄂尔多斯乌审旗林业局,内蒙古 达布察克 017300
  • 5. 鄂尔多斯造林总场,内蒙古 树林召 014300
  • 折叠

摘要

为揭示北沙柳(Salix psammophila)的遗传多样性、遗传结构及分化特征,利用叶绿体非编码区序列(trnL-trnF和trnD-trnT)对分布于毛乌素沙地和库布齐沙漠的16个北沙柳居群(339个个体)进行了遗传研究,为北沙柳种子资源库遗传管理、遗传改良、遗传育种及品种选育提供理论依据.结果表明:(1)经trnL-trnF和trnD-trnT片段联合比对获得了1811 bp序列,共有12个核苷酸变异位点(8个简约信息位点,4个变异位点),得到16个单倍型.(2)单倍型多样性指数(Hd)为0.737,核苷酸多样性指数(π)为0.00107;且单倍型H3的分布在所有居群中位于单倍型网络图中心,其余单倍型随机分布于各个居群.(3)AMOVA分析表明,北沙柳cpDNA的变异主要来源于居群内(91.16%),居群间遗传分化程度中等(FST=0.08837),各居群间的基因交流非常频繁(Nm=2.58);遗传分化系数NST(0.085)显著大于GST(0.056,0.01<P<0.05),表明北沙柳居群具有明显的分子谱系地理结构.(4)中性检验及失配分析表明,北沙柳居群分布范围没有发生明显扩张的痕迹.

关键词

北沙柳/cpDNA/遗传多样性/单倍型/遗传结构

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基金项目

内蒙古自治区自然科学基金(2018MS03013)

出版年

2020
西北植物学报
西北农林科技大学,陕西省植物学会

西北植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.031
ISSN:1000-4025
被引量1
参考文献量24
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